More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3020 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3020  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
185 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.24182  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20290  predicted flavoprotein  64.09 
 
 
184 aa  238  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.690539  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1572  NADPH-dependent FMN reductase  61.54 
 
 
185 aa  225  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34430  predicted flavoprotein  62.94 
 
 
188 aa  219  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111686  normal  0.581519 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3810  NADPH-dependent FMN reductase  59.77 
 
 
185 aa  207  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4019  NADPH-dependent FMN reductase  60.69 
 
 
188 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13071  hypothetical protein  51.69 
 
 
184 aa  192  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2039  NADPH-dependent FMN reductase  56.5 
 
 
195 aa  184  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.343608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1814  NADPH-dependent FMN reductase  53.89 
 
 
188 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.9444  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1795  NADPH-dependent FMN reductase  53.89 
 
 
188 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709861  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1861  NADPH-dependent FMN reductase  53.89 
 
 
188 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.91747  normal  0.2434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4308  NADPH-dependent FMN reductase  54.7 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3359  NADPH-dependent FMN reductase  56.46 
 
 
183 aa  170  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3292  NADPH-dependent FMN reductase  44.92 
 
 
188 aa  148  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.519739  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 
185 aa  132  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  36.41 
 
 
189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  34.64 
 
 
189 aa  108  5e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 
184 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2972  NADPH-dependent FMN reductase  42.39 
 
 
177 aa  107  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  36.26 
 
 
184 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  36.26 
 
 
184 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  36.26 
 
 
184 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  32.42 
 
 
183 aa  104  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  42.31 
 
 
184 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  42.31 
 
 
184 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  39.55 
 
 
182 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  33.71 
 
 
186 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
186 aa  101  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  39.62 
 
 
187 aa  102  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  33.71 
 
 
186 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 
180 aa  100  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  33.71 
 
 
186 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.95 
 
 
187 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.2 
 
 
185 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.2 
 
 
185 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  35.2 
 
 
185 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.2 
 
 
185 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.2 
 
 
185 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 
184 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 
184 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  34.44 
 
 
186 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
187 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.2 
 
 
185 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.2 
 
 
185 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  37.36 
 
 
197 aa  99.8  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  42.86 
 
 
184 aa  99  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  42.86 
 
 
183 aa  99.4  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  42.86 
 
 
183 aa  99  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  38.93 
 
 
185 aa  99.4  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  31.32 
 
 
183 aa  99  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  38.28 
 
 
188 aa  99  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  42.52 
 
 
184 aa  98.6  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2763  NADPH-dependent FMN reductase  29.28 
 
 
181 aa  97.8  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  41.09 
 
 
184 aa  97.8  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  39.84 
 
 
188 aa  97.8  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  41.41 
 
 
189 aa  97.8  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  36.48 
 
 
190 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  41.09 
 
 
184 aa  97.1  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  33.71 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  41.09 
 
 
184 aa  96.7  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  37.91 
 
 
186 aa  96.3  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.334684 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  37.5 
 
 
188 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
188 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
188 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
188 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  35.4 
 
 
184 aa  95.5  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
188 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
188 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  37.5 
 
 
188 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  41.86 
 
 
182 aa  95.5  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  36.88 
 
 
184 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.64 
 
 
180 aa  95.1  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 
192 aa  94.7  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  44.53 
 
 
185 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  36.72 
 
 
188 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  43.7 
 
 
185 aa  94  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  37.8 
 
 
188 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  37.8 
 
 
188 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  37.8 
 
 
188 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  37.8 
 
 
194 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  28.73 
 
 
184 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  37.8 
 
 
188 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  34.94 
 
 
186 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  33.71 
 
 
185 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  35.16 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4080  NADPH-dependent FMN reductase  32.02 
 
 
186 aa  92.8  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0440178  normal  0.0878712 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 
184 aa  92.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  39.06 
 
 
187 aa  92  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
190 aa  92  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  40.44 
 
 
185 aa  92  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  41.46 
 
 
183 aa  91.7  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3311  NADPH-dependent FMN reductase  35.48 
 
 
190 aa  91.7  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  34.76 
 
 
185 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  31.49 
 
 
204 aa  91.3  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0477  NADPH-dependent FMN reductase  35.06 
 
 
181 aa  90.9  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307827  normal  0.877798 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  39.37 
 
 
183 aa  90.9  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  41.46 
 
 
182 aa  90.9  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  39.83 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  34.42 
 
 
190 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  34.36 
 
 
190 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>