260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3359 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3359  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
183 aa  360  6e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3020  NADPH-dependent FMN reductase  56.46 
 
 
185 aa  170  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.24182  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13071  hypothetical protein  54.55 
 
 
184 aa  156  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34430  predicted flavoprotein  59.72 
 
 
188 aa  155  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111686  normal  0.581519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20290  predicted flavoprotein  50.85 
 
 
184 aa  150  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.690539  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1814  NADPH-dependent FMN reductase  52.6 
 
 
188 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.9444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1861  NADPH-dependent FMN reductase  52.6 
 
 
188 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.91747  normal  0.2434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1795  NADPH-dependent FMN reductase  52.6 
 
 
188 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709861  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3810  NADPH-dependent FMN reductase  49.41 
 
 
185 aa  141  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4019  NADPH-dependent FMN reductase  49.71 
 
 
188 aa  140  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2039  NADPH-dependent FMN reductase  49.14 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.343608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3292  NADPH-dependent FMN reductase  48.55 
 
 
188 aa  138  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.519739  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1572  NADPH-dependent FMN reductase  53.06 
 
 
185 aa  135  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4308  NADPH-dependent FMN reductase  48.6 
 
 
183 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  41.13 
 
 
182 aa  110  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  48.33 
 
 
189 aa  110  9e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  42.98 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  49.24 
 
 
189 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  51.61 
 
 
187 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
186 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  47.73 
 
 
194 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  48.74 
 
 
186 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  47.9 
 
 
186 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  45.3 
 
 
183 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  44.19 
 
 
184 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  44.19 
 
 
184 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  49.58 
 
 
185 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  51.33 
 
 
184 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 
185 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  47.9 
 
 
186 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  45.9 
 
 
185 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  46.15 
 
 
184 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  44.83 
 
 
184 aa  101  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  45.3 
 
 
184 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  45.3 
 
 
184 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  45.3 
 
 
184 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  43.85 
 
 
185 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  46.22 
 
 
183 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  46.22 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  46.15 
 
 
184 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  44.44 
 
 
185 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 
184 aa  99  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  44.44 
 
 
185 aa  99  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2972  NADPH-dependent FMN reductase  46.76 
 
 
177 aa  99.4  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  43.97 
 
 
190 aa  99.4  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  44.44 
 
 
185 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 
185 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  43.8 
 
 
185 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  43.8 
 
 
185 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 
183 aa  99  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  43.8 
 
 
185 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  43.8 
 
 
185 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  42.64 
 
 
188 aa  98.6  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4056  NADPH-dependent FMN reductase  49.18 
 
 
184 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  43.22 
 
 
187 aa  97.4  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  43.1 
 
 
184 aa  97.4  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  47.79 
 
 
186 aa  97.1  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  44.78 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  42.75 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  46.43 
 
 
184 aa  95.9  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  46.43 
 
 
184 aa  95.5  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2299  NADPH-dependent FMN reductase  38.57 
 
 
181 aa  95.1  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197396  hitchhiker  0.00422295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  40.52 
 
 
182 aa  95.1  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  47.79 
 
 
184 aa  94.7  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  47.79 
 
 
184 aa  94.4  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  46.15 
 
 
185 aa  94.4  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  41.86 
 
 
184 aa  93.6  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  52.1 
 
 
186 aa  94  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  43.1 
 
 
190 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  48.31 
 
 
206 aa  94  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  43.1 
 
 
190 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  46.02 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  45.61 
 
 
183 aa  92  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  38.52 
 
 
184 aa  92  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 
183 aa  91.3  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  35.96 
 
 
180 aa  91.3  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.32 
 
 
180 aa  91.3  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  42.37 
 
 
203 aa  90.9  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  43.36 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  43.86 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  46.43 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.6 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  46.43 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  45.61 
 
 
183 aa  88.2  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  32.78 
 
 
194 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  41.43 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  45.38 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  45.13 
 
 
183 aa  87  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  32.22 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  48.72 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  34.07 
 
 
188 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  44.44 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  43.75 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  34.07 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  32.22 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  32.22 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  32.24 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
189 aa  85.1  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  38.79 
 
 
186 aa  85.1  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>