210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2972 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2972  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
177 aa  345  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4308  NADPH-dependent FMN reductase  48.84 
 
 
183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3020  NADPH-dependent FMN reductase  43.58 
 
 
185 aa  123  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.24182  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2039  NADPH-dependent FMN reductase  46.24 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.343608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20290  predicted flavoprotein  45.41 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.690539  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34430  predicted flavoprotein  42.08 
 
 
188 aa  115  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111686  normal  0.581519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3359  NADPH-dependent FMN reductase  46.81 
 
 
183 aa  115  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13071  hypothetical protein  45.22 
 
 
184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1814  NADPH-dependent FMN reductase  42.08 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.9444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1861  NADPH-dependent FMN reductase  42.08 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.91747  normal  0.2434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1795  NADPH-dependent FMN reductase  42.08 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709861  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  46.79 
 
 
189 aa  104  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1572  NADPH-dependent FMN reductase  40.56 
 
 
185 aa  102  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3810  NADPH-dependent FMN reductase  46.31 
 
 
185 aa  100  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4019  NADPH-dependent FMN reductase  47.65 
 
 
188 aa  100  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  44.74 
 
 
184 aa  97.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  44.74 
 
 
184 aa  97.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3292  NADPH-dependent FMN reductase  43.06 
 
 
188 aa  95.9  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.519739  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  43.86 
 
 
184 aa  95.1  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.81 
 
 
181 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  46.09 
 
 
182 aa  92.8  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  44.35 
 
 
184 aa  92.8  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  42.24 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  41.38 
 
 
186 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  46.55 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4056  NADPH-dependent FMN reductase  51.46 
 
 
184 aa  89  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  43.48 
 
 
192 aa  88.6  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  45.05 
 
 
185 aa  89  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  43.59 
 
 
188 aa  88.2  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  41.38 
 
 
186 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  41.38 
 
 
186 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  41.82 
 
 
184 aa  87.8  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  42.73 
 
 
184 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  47.79 
 
 
185 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  44.55 
 
 
184 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  42.11 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  42.73 
 
 
184 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  42.73 
 
 
184 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  42.73 
 
 
184 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  45.87 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  40.91 
 
 
183 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  42.31 
 
 
185 aa  84.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  41.82 
 
 
183 aa  84.7  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  44.83 
 
 
186 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  40.35 
 
 
183 aa  84.3  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  40.35 
 
 
183 aa  84.3  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  43.86 
 
 
194 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  43.64 
 
 
184 aa  84.3  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  41.82 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  41.82 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  40 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  41.82 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  41.82 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  41.82 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  41.82 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  41.82 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  45.28 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  39.81 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  40.35 
 
 
184 aa  82  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  43.59 
 
 
183 aa  82  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  45.87 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  40.91 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  40.19 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  40.52 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2299  NADPH-dependent FMN reductase  45.19 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197396  hitchhiker  0.00422295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  41.12 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  37.31 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  37.78 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
183 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  39.81 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
189 aa  77.8  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  38.74 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  39.09 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  36.94 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  45.63 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  42.98 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.29 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  37.39 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  37.61 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  41.74 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1677  NADPH-dependent FMN reductase  41.35 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  41.96 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  36.67 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  36.67 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  38.04 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  35.34 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  38.14 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  39.64 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  39.82 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  36.52 
 
 
203 aa  72  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  39.13 
 
 
206 aa  70.9  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  36.52 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.61 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  36.75 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  36.75 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  33.63 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>