More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0682 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
197 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  57.3 
 
 
192 aa  227  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  43.75 
 
 
197 aa  152  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  44.68 
 
 
212 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  42.55 
 
 
193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  42.49 
 
 
192 aa  143  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  42.02 
 
 
189 aa  143  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0388  NADPH-dependent FMN reductase  45.55 
 
 
193 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0432  NADPH-dependent FMN reductase  43.62 
 
 
193 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  44.24 
 
 
192 aa  132  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  38.59 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  43.64 
 
 
230 aa  124  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  36.7 
 
 
195 aa  123  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  36.76 
 
 
188 aa  123  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
192 aa  115  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  36.02 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
193 aa  104  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  34.55 
 
 
195 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  34.41 
 
 
189 aa  95.5  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  32.97 
 
 
185 aa  94.7  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  34.27 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  32.02 
 
 
216 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3798  NADPH-dependent FMN reductase  32.65 
 
 
202 aa  91.3  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000652253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  34.76 
 
 
192 aa  91.3  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
201 aa  91.3  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  37.33 
 
 
188 aa  89.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  37.65 
 
 
186 aa  89  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2081  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 
180 aa  89  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  32.57 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 
178 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  37.84 
 
 
188 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 
178 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  36.49 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.95 
 
 
180 aa  85.1  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 
220 aa  84.7  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  36.49 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  36.49 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  36.49 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  36.49 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  36.49 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  36.49 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  36.49 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  36.49 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  36 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  36 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  36 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  36 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  36 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  38.51 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  35.75 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  31.18 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  34.76 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  31.07 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  34.48 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  36.57 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  27.96 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  29.95 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  30.12 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  35.91 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.43 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  27.98 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3020  NADPH-dependent FMN reductase  32.62 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.24182  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  34.46 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  32.1 
 
 
189 aa  77  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  30.91 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  36.63 
 
 
185 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  33.51 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20290  predicted flavoprotein  34.32 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.690539  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09863  hypothetical protein  29.32 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.9 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  27.42 
 
 
181 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  32.11 
 
 
181 aa  74.3  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  30.11 
 
 
179 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1572  NADPH-dependent FMN reductase  35.33 
 
 
185 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  29.67 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3754  NADPH-dependent FMN reductase  30.32 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  27.32 
 
 
187 aa  72  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 
192 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  33.91 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  28.93 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  28.27 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  28.27 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  28.11 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3810  NADPH-dependent FMN reductase  34.69 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5221  NADPH-dependent FMN reductase  26.6 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.681461  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  29.95 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  39.34 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34430  predicted flavoprotein  32.28 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111686  normal  0.581519 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  38.52 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  29.47 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3211  NADPH-dependent FMN reductase  32.64 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.870894  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0184  NADPH-dependent FMN reductase  31.95 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>