More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0332 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  82.2 
 
 		 193 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0432  NADPH-dependent FMN reductase  83.77 
 
 		 193 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0388  NADPH-dependent FMN reductase  83.77 
 
 		 193 aa  304  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  68.95 
 
 		 197 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  67.37 
 
 		 192 aa  261  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  44.68 
 
 		 197 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  42.62 
 
 		 189 aa  142  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  40.72 
 
 		 195 aa  131  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  40.64 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  36.7 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  43.55 
 
 		 187 aa  128  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  42.33 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  37.77 
 
 		 188 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  40.93 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  39.49 
 
 		 195 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  39.46 
 
 		 216 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  38.38 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  38.38 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3798  NADPH-dependent FMN reductase  40.64 
 
 		 202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000652253 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  41.3 
 
 		 193 aa  108  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  36.76 
 
 		 192 aa  104  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  39.13 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  35.11 
 
 		 186 aa  95.1  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 181 aa  93.2  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  31.77 
 
 		 188 aa  87.8  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  31.09 
 
 		 188 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  37.95 
 
 		 186 aa  87  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2081  NADPH-dependent FMN reductase  35.09 
 
 		 180 aa  87  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.505082 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  31.77 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  31.77 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  31.77 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  31.77 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  31.77 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  31.77 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  31.77 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  31.77 
 
 		 188 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  34.81 
 
 		 180 aa  85.5  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 173 aa  85.1  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  31.63 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  32.99 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  30.05 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  30.05 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  30.05 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  30.05 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  32.29 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  32.29 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  29.53 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  34.18 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  43.75 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  43.75 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  31.38 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  34.93 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  34.93 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  37.67 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  36.42 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 		 189 aa  72  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0184  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  38.76 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  34 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13071  hypothetical protein  35.61 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4308  NADPH-dependent FMN reductase  34.73 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  36.09 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20290  predicted flavoprotein  34.95 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.690539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3619  FMN reductase, NADPH-dependent  26.92 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  36.47 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  27.64 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34430  predicted flavoprotein  39.23 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111686  normal  0.581519 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  36.81 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3311  NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3359  NADPH-dependent FMN reductase  32.8 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0154  NADPH-dependent FMN reductase  34.32 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  29.26 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  26.84 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  30.16 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  30.16 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  29.19 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  40.38 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  32.11 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  31.09 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  31.94 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  31.02 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  29.38 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1814  NADPH-dependent FMN reductase  39.26 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.9444  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  30.99 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  33.79 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  35.66 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1861  NADPH-dependent FMN reductase  39.26 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.91747  normal  0.2434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1795  NADPH-dependent FMN reductase  39.26 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709861  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  26.32 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  29.57 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  31.69 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  25.88 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1572  NADPH-dependent FMN reductase  39.8 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  34.03 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  28.79 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>