More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2576 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
189 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  52.3 
 
 
188 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  49.07 
 
 
192 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  39.04 
 
 
192 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  40.12 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  46.67 
 
 
230 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  43.72 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  42.02 
 
 
197 aa  143  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  41.49 
 
 
197 aa  142  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  44.51 
 
 
187 aa  142  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  42.62 
 
 
212 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0432  NADPH-dependent FMN reductase  43.72 
 
 
193 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  42.44 
 
 
194 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  42.44 
 
 
194 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0388  NADPH-dependent FMN reductase  44.75 
 
 
193 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  40.11 
 
 
192 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  39.89 
 
 
201 aa  133  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  41.71 
 
 
190 aa  132  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  39.89 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  39.67 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  39.57 
 
 
195 aa  124  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  39.16 
 
 
216 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3798  NADPH-dependent FMN reductase  36.46 
 
 
202 aa  101  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000652253 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2081  NADPH-dependent FMN reductase  42.14 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  35.16 
 
 
192 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  33.91 
 
 
186 aa  88.6  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  34.08 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  33.9 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
180 aa  87.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  33.71 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  33.71 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  32.95 
 
 
181 aa  85.9  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
193 aa  86.3  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  31.75 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  30.98 
 
 
178 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  30.98 
 
 
178 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  34.08 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  32.94 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  29.73 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  32.97 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  31.55 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.52 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  32.35 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  32.79 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  31.55 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  30.57 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  32.35 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 
220 aa  79  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.87 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.6 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.6 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.6 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.6 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.6 
 
 
185 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  29.73 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  33.92 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  30.6 
 
 
185 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  29.35 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.6 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.6 
 
 
185 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  30.6 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  30.05 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  30.89 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  32.94 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  31.74 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  35.39 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1677  NADPH-dependent FMN reductase  33.72 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  35.77 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  32.94 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  32.54 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  29.19 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  32.76 
 
 
173 aa  74.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  32.9 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  29.73 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  31.98 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  30.6 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  34.94 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  29.03 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  35.04 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  29.21 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  31.21 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  32.05 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  29.57 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  34.32 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20290  predicted flavoprotein  32.32 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.690539  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  34.91 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2933  NADPH-dependent FMN reductase  26.37 
 
 
192 aa  70.9  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.89226  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  32.68 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  32.89 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  35.81 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  32.68 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  34.12 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  32.05 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2657  NADPH-dependent FMN reductase  29.19 
 
 
171 aa  70.5  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0489341 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  32.68 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>