More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0388 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0388  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 193 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  88.08 
 
 		 193 aa  348  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0432  NADPH-dependent FMN reductase  92.75 
 
 		 193 aa  347  4e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  83.77 
 
 		 212 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  67.71 
 
 		 192 aa  271  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  68.45 
 
 		 197 aa  264  7e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  45.55 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  46.15 
 
 		 189 aa  143  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  42.78 
 
 		 192 aa  131  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  37.82 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  38.12 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  44.81 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  39.04 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  40.11 
 
 		 187 aa  118  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  39.15 
 
 		 216 aa  117  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  44.17 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  39.18 
 
 		 195 aa  114  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  37.3 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  37.3 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  38.59 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3798  NADPH-dependent FMN reductase  40.98 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000652253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  36.79 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  37.77 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  34.76 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  36.22 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  32.99 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  33.69 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  37.72 
 
 		 186 aa  88.6  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 		 188 aa  87.8  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  33.68 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  33.68 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  39.57 
 
 		 188 aa  85.9  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  31.96 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  34.9 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  33.16 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  33.16 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  33.16 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  33.16 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  38.52 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2081  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  32.63 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  34.38 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  34.71 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  33.67 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  37.33 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  31.94 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  33.16 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  33.51 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  35.37 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  35.37 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  39.52 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  34.71 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3311  NADPH-dependent FMN reductase  34.9 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.05 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.05 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  32.97 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.05 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.05 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  34.07 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13071  hypothetical protein  33.16 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  36.05 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.05 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  32.11 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.05 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  32.11 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  36.05 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  34.01 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0154  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 		 181 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  36.3 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20290  predicted flavoprotein  47 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.690539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.75 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.24 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  31.32 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  34.13 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  34.73 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  36.23 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  35.33 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  35.53 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34430  predicted flavoprotein  40.46 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111686  normal  0.581519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  31.75 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  39.29 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  33.09 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  29.47 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0184  NADPH-dependent FMN reductase  34.43 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  33.09 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  36.23 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  36.23 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  36.23 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  29.57 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>