More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02783 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  100 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  52.3 
 
 		 189 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  50.84 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  47.37 
 
 		 192 aa  158  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  41.94 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  38.76 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  40.41 
 
 		 194 aa  135  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  40.41 
 
 		 194 aa  135  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  45.73 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  42.22 
 
 		 192 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  41.04 
 
 		 190 aa  125  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  35.6 
 
 		 195 aa  125  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  37.77 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  36.76 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  37.89 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  42.76 
 
 		 197 aa  121  7e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0388  NADPH-dependent FMN reductase  44.81 
 
 		 193 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0432  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  40.21 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 216 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2081  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.57 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3798  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 		 202 aa  100  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000652253 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  36.05 
 
 		 179 aa  97.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  36.02 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  36.72 
 
 		 192 aa  95.5  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2657  NADPH-dependent FMN reductase  36.42 
 
 		 171 aa  94.7  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  38.1 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  32.61 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  42.07 
 
 		 189 aa  92.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  35.03 
 
 		 188 aa  91.7  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2933  NADPH-dependent FMN reductase  29.51 
 
 		 192 aa  91.7  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.89226  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  29.79 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  36.9 
 
 		 185 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  35.47 
 
 		 220 aa  87.8  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  35.11 
 
 		 185 aa  87.8  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1695  hypothetical protein  35 
 
 		 175 aa  87.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.154497  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  38.89 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  38.89 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  38.89 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  38.89 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  38.89 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  37.93 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  35.5 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  37.93 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  35.33 
 
 		 183 aa  86.3  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  32.95 
 
 		 189 aa  85.5  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2199  NADPH-dependent FMN reductase  27.32 
 
 		 192 aa  84.7  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  32.98 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  33.71 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09863  hypothetical protein  33.1 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  34.04 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002868  hypothetical protein  38.76 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.277504  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1275  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03109  hypothetical protein  32.37 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2470  NADPH-dependent FMN reductase  33.88 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.469467  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  34.64 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  35.06 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2123  NADPH-dependent FMN reductase  27.47 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  32.04 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3619  FMN reductase, NADPH-dependent  35.66 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  30.16 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  34.1 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1202  NADPH-dependent FMN reductase  38.93 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  27.66 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3574  hypothetical protein  41 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.32 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.32 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.32 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.35 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.32 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1677  NADPH-dependent FMN reductase  32.09 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.32 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13071  hypothetical protein  36.71 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  30.32 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.32 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0876  flavoprotein  31.94 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000003424  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  30.94 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3211  NADPH-dependent FMN reductase  39 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.870894  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  35.86 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  31.52 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  32.75 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  30.16 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>