186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3574 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3574  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  361  3e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3754  NADPH-dependent FMN reductase  84.28 
 
 		 173 aa  284  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3211  NADPH-dependent FMN reductase  83.53 
 
 		 173 aa  280  8.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.870894  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03109  hypothetical protein  65.9 
 
 		 174 aa  248  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1243  FMN reductase, NADPH-dependent  73.41 
 
 		 174 aa  245  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3619  FMN reductase, NADPH-dependent  64.74 
 
 		 177 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002868  hypothetical protein  61.49 
 
 		 174 aa  231  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.277504  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1695  hypothetical protein  58.38 
 
 		 175 aa  216  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.154497  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0302  hypothetical protein  60.38 
 
 		 179 aa  208  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247279 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1037  hypothetical protein  68.94 
 
 		 132 aa  207  7e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1015  NADPH-dependent FMN reductase  66.01 
 
 		 173 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2470  NADPH-dependent FMN reductase  51.76 
 
 		 174 aa  193  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.469467  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2657  NADPH-dependent FMN reductase  53.18 
 
 		 171 aa  191  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489341 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09863  hypothetical protein  40.83 
 
 		 202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2081  NADPH-dependent FMN reductase  39.08 
 
 		 180 aa  110  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  39.53 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  32.28 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  28.81 
 
 		 216 aa  74.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  29.55 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  34.45 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  32.52 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  35.2 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  33.05 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  37.72 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  34.96 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  35.05 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  35.05 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  33.08 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  30.08 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  35.78 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  31.45 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  30.25 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  30.95 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  27.15 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  33.67 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0262  NADPH-dependent FMN reductase  32.17 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33413  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  32.56 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  34.92 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  30.23 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0413  hypothetical protein  32 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000247794  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  29.82 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  33.91 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  33.91 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  36.08 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1083  hypothetical protein  33.04 
 
 		 411 aa  57  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0432  NADPH-dependent FMN reductase  32.33 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  30.92 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1750  flavoprotein  28.14 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  33.62 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1082  hypothetical protein  27.27 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137626  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  33.62 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  30.71 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  34.26 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.23 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  30.92 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  30.92 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  30.92 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  30.33 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  31.62 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  30.92 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1202  NADPH-dependent FMN reductase  32.79 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  32.48 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0388  NADPH-dependent FMN reductase  33.08 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  27.82 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  31.15 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3020  NADPH-dependent FMN reductase  31.93 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.24182  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  32.23 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  28.24 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  31.25 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  32.23 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  29.61 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  25.33 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  30.77 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  31.4 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0184  NADPH-dependent FMN reductase  29.52 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  31.2 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  31.54 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  31.3 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  28.06 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  28.1 
 
 		 183 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  27.84 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.57 
 
 		 181 aa  51.6  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  26.96 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20290  predicted flavoprotein  31.62 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.690539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1444  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.41 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  28.45 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1749  flavoprotein  30.4 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000367939  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>