More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1202 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1202  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
182 aa  368  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0100  hypothetical protein  40.76 
 
 
183 aa  132  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000132763  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  45.16 
 
 
187 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  40.43 
 
 
187 aa  110  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  44.14 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.94 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  39.25 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  47.47 
 
 
186 aa  85.9  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  39.47 
 
 
184 aa  84.3  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  39.47 
 
 
184 aa  84.3  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  36.52 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  36.52 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  36.21 
 
 
182 aa  82  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  38.26 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 
183 aa  82  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 
195 aa  82  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  35.65 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.65 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  40.34 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  36.21 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  36.75 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  36.75 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.21 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.21 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  38.93 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.52 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.52 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.52 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.52 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  33.91 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  35.09 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1444  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.57 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  34.78 
 
 
183 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  41.24 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  41.3 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  34.78 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  34.78 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  34.78 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  33.91 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  40.86 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  42 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  32.61 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  31.3 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  32.87 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  41.24 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  42 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  42 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  42 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  32.17 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  42 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  42 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1677  NADPH-dependent FMN reductase  31.3 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  42 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  42 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  37.39 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  35.09 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  41.3 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  34.21 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  41.94 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3020  NADPH-dependent FMN reductase  38.54 
 
 
185 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.24182  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  42 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  34.71 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  39.09 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  31.3 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  44.55 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  36.43 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13071  hypothetical protein  34.29 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  41 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  38.04 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  33.57 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  31.62 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  35.77 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0263  NADPH-dependent FMN reductase  39.78 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.478273  normal  0.331111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  33.05 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  36.56 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  36.59 
 
 
194 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  32.76 
 
 
190 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  35.07 
 
 
183 aa  72  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  42.71 
 
 
181 aa  72  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  31.62 
 
 
189 aa  72  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  30.88 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  30.88 
 
 
186 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  32.2 
 
 
190 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  30.28 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.69 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1083  hypothetical protein  35.16 
 
 
411 aa  71.2  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.69 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  34.78 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  41.24 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  41.24 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0876  flavoprotein  35.92 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000003424  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  41.24 
 
 
188 aa  70.9  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  41.24 
 
 
188 aa  70.9  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  41.24 
 
 
188 aa  70.9  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  39.8 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  37.38 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>