277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0263 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0263  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 202 aa  409  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.478273  normal  0.331111 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1082  hypothetical protein  65.67 
 
 		 200 aa  287  7e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137626  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0262  NADPH-dependent FMN reductase  47.87 
 
 		 403 aa  187  9e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33413  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1083  hypothetical protein  48.31 
 
 		 411 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0413  hypothetical protein  48.31 
 
 		 267 aa  177  8e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000247794  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  41.67 
 
 		 416 aa  153  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0090  NADPH-dependent FMN reductase  36.65 
 
 		 203 aa  147  7e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000795412  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1750  flavoprotein  41.71 
 
 		 180 aa  147  7e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1749  flavoprotein  42.55 
 
 		 184 aa  144  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000367939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  36.97 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 		 193 aa  104  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  33.91 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  38.22 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  36.21 
 
 		 184 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.14 
 
 		 181 aa  99  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  35.63 
 
 		 184 aa  99  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  33.73 
 
 		 184 aa  98.6  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  33.73 
 
 		 184 aa  98.6  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 		 220 aa  97.8  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.9 
 
 		 187 aa  97.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  32.92 
 
 		 189 aa  96.3  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  36.26 
 
 		 188 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  36.26 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  36.26 
 
 		 188 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  36.26 
 
 		 188 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  36.2 
 
 		 186 aa  95.9  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  36.41 
 
 		 188 aa  95.5  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  35.71 
 
 		 194 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  32.97 
 
 		 186 aa  94.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.73 
 
 		 180 aa  93.6  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  35.87 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  35.87 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  35.87 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  35.87 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  35.87 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  35.87 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  35.87 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  35.87 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  39.84 
 
 		 184 aa  92  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 		 183 aa  91.7  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  32.57 
 
 		 180 aa  91.3  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  32.4 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  32.61 
 
 		 185 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  36.25 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 188 aa  90.5  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  32.18 
 
 		 184 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  32.8 
 
 		 183 aa  89.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  36.64 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  29.78 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 		 184 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 		 184 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 		 184 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  31.46 
 
 		 183 aa  89  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  32.97 
 
 		 186 aa  88.6  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  35.62 
 
 		 186 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 206 aa  88.2  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.15 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  33.73 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  31.15 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.6 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  31.65 
 
 		 182 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  32.77 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.6 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  30.86 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.6 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.6 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.6 
 
 		 185 aa  85.9  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.6 
 
 		 185 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  31.49 
 
 		 184 aa  85.1  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  34.5 
 
 		 181 aa  84.7  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  32.77 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  30.29 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  28.99 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  30.29 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  31.67 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  37.4 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  31.11 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  31.11 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  34.13 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  31.11 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  36.64 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  28.79 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  30.11 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  35.11 
 
 		 183 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  35.11 
 
 		 183 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  33.52 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  35.88 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  29.67 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  35.88 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  31.06 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  28.28 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  30.51 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  28.34 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  32.33 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3311  NADPH-dependent FMN reductase  34.96 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>