270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0090 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0090  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
203 aa  421  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000795412  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1083  hypothetical protein  46.77 
 
 
411 aa  190  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0262  NADPH-dependent FMN reductase  44.5 
 
 
403 aa  184  8e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33413  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0263  NADPH-dependent FMN reductase  37.17 
 
 
202 aa  159  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.478273  normal  0.331111 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0413  hypothetical protein  41.94 
 
 
267 aa  157  8e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000247794  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1082  hypothetical protein  39.56 
 
 
200 aa  155  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137626  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1750  flavoprotein  44.77 
 
 
180 aa  154  8e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117667  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
416 aa  143  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1749  flavoprotein  35.39 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000367939  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  39.88 
 
 
186 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.86 
 
 
180 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 
192 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  30.94 
 
 
184 aa  95.9  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  30.94 
 
 
184 aa  95.9  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  29.38 
 
 
184 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.6 
 
 
181 aa  95.9  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  31.41 
 
 
189 aa  95.9  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  31.49 
 
 
220 aa  94.7  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  31.64 
 
 
184 aa  94.7  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  31.49 
 
 
184 aa  94  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  31.49 
 
 
190 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  29.38 
 
 
183 aa  92  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  29.47 
 
 
193 aa  91.3  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  30.94 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  32.96 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  32.93 
 
 
189 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 
190 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.75 
 
 
187 aa  88.6  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  25.82 
 
 
183 aa  88.2  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  32.92 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  28.09 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  32.3 
 
 
186 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  28.98 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  28.33 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  32.73 
 
 
189 aa  85.9  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  30.6 
 
 
188 aa  84.7  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  29.44 
 
 
184 aa  84.7  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  26.7 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  26.7 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 
184 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 
190 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  26.7 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 
188 aa  84.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  26.7 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  28.16 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  26.7 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  26.7 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  28.89 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  29.44 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  26.7 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  27.22 
 
 
184 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  27.22 
 
 
184 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3311  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  27.01 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  24.72 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  31.47 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  27.17 
 
 
194 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  31.02 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  26.88 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  26.88 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  26.88 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  26.88 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  26.88 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  26.88 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  26.88 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  26.88 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  26.88 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  26.63 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  26.63 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  26.63 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  27.03 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  31.72 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  27.93 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  28.88 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  27.84 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  27.37 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  29.14 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  28.11 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  28.02 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  29.05 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  29.07 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  26.44 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  28.38 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  26.32 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  26.01 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  28.88 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  25.95 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  25.95 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  25.41 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  25.86 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  25.41 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  32.26 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  26.92 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  25.82 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  26.23 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>