195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3211 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3211  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
173 aa  348  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.870894  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3574  hypothetical protein  83.53 
 
 
177 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3754  NADPH-dependent FMN reductase  81.76 
 
 
173 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1243  FMN reductase, NADPH-dependent  82.08 
 
 
174 aa  270  7e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03109  hypothetical protein  67.05 
 
 
174 aa  251  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3619  FMN reductase, NADPH-dependent  64.74 
 
 
177 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002868  hypothetical protein  64.74 
 
 
174 aa  239  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.277504  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1695  hypothetical protein  61.27 
 
 
175 aa  226  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.154497  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1037  hypothetical protein  73.48 
 
 
132 aa  214  5.9999999999999996e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0302  hypothetical protein  62.21 
 
 
179 aa  210  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247279 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1015  NADPH-dependent FMN reductase  63.58 
 
 
173 aa  206  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2657  NADPH-dependent FMN reductase  55.56 
 
 
171 aa  198  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0489341 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2470  NADPH-dependent FMN reductase  51.18 
 
 
174 aa  191  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.469467  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09863  hypothetical protein  40 
 
 
202 aa  129  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2081  NADPH-dependent FMN reductase  37.79 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  37.98 
 
 
188 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  34.18 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  32.23 
 
 
216 aa  74.7  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  37.3 
 
 
189 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  30.99 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  28.79 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  33.61 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  35.59 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  34.4 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  36.08 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  37.3 
 
 
192 aa  67.8  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  36.08 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  27.47 
 
 
186 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  31.54 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  32.48 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  30.54 
 
 
192 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  30.08 
 
 
193 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  31.68 
 
 
185 aa  62.8  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1750  flavoprotein  30.13 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117667  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.54 
 
 
180 aa  62.4  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  32.08 
 
 
187 aa  62  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
193 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  36.08 
 
 
195 aa  61.2  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  29.66 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  31.5 
 
 
186 aa  59.7  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  33.67 
 
 
192 aa  58.9  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  31.15 
 
 
184 aa  58.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  27.98 
 
 
212 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  34.21 
 
 
189 aa  58.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  32.76 
 
 
186 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 
184 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0413  hypothetical protein  30 
 
 
267 aa  57.4  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000247794  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
192 aa  57.4  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 
184 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1083  hypothetical protein  30.7 
 
 
411 aa  57  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1202  NADPH-dependent FMN reductase  33.87 
 
 
182 aa  57  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
184 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  31.2 
 
 
193 aa  57  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  30.89 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1082  hypothetical protein  29.75 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137626  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0432  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
193 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.05 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  33.62 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0262  NADPH-dependent FMN reductase  28.95 
 
 
403 aa  55.8  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33413  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0388  NADPH-dependent FMN reductase  33.08 
 
 
193 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  32.76 
 
 
185 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  28.23 
 
 
180 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  32.06 
 
 
187 aa  55.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2828  NADPH-dependent FMN reductase  27.83 
 
 
194 aa  55.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  33.9 
 
 
185 aa  55.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 
188 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
185 aa  55.1  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  32.48 
 
 
185 aa  55.1  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0184  NADPH-dependent FMN reductase  30.17 
 
 
184 aa  54.7  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  28.24 
 
 
197 aa  54.7  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  32.5 
 
 
184 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2123  NADPH-dependent FMN reductase  34.38 
 
 
195 aa  54.7  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  32.5 
 
 
184 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  32.5 
 
 
184 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  32.5 
 
 
184 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  32.29 
 
 
186 aa  54.7  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3020  NADPH-dependent FMN reductase  31.93 
 
 
185 aa  54.7  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.24182  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  24.82 
 
 
183 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  34.18 
 
 
220 aa  53.9  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  31.67 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1444  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  31.67 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  30.91 
 
 
184 aa  52.4  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30 
 
 
185 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  28.45 
 
 
185 aa  52.4  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2933  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 
192 aa  52.4  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.89226  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3359  NADPH-dependent FMN reductase  27.17 
 
 
183 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30 
 
 
185 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
185 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.77 
 
 
181 aa  52  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 
188 aa  52  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30 
 
 
185 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  32.73 
 
 
190 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  32.73 
 
 
190 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30 
 
 
185 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30 
 
 
185 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30 
 
 
185 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
190 aa  51.2  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>