137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1037 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1037  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  268  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3211  NADPH-dependent FMN reductase  73.48 
 
 
173 aa  213  8e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.870894  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3574  hypothetical protein  68.94 
 
 
177 aa  206  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3754  NADPH-dependent FMN reductase  66.67 
 
 
173 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1243  FMN reductase, NADPH-dependent  65.15 
 
 
174 aa  192  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03109  hypothetical protein  65.15 
 
 
174 aa  187  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002868  hypothetical protein  63.64 
 
 
174 aa  179  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.277504  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3619  FMN reductase, NADPH-dependent  59.09 
 
 
177 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0302  hypothetical protein  59.09 
 
 
179 aa  168  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247279 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1695  hypothetical protein  58.33 
 
 
175 aa  168  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.154497  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1015  NADPH-dependent FMN reductase  59.09 
 
 
173 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2657  NADPH-dependent FMN reductase  53.79 
 
 
171 aa  150  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0489341 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2470  NADPH-dependent FMN reductase  54.26 
 
 
174 aa  147  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.469467  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09863  hypothetical protein  40 
 
 
202 aa  101  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2081  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  34.31 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  30.3 
 
 
216 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  29.1 
 
 
181 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  37.97 
 
 
220 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  36.23 
 
 
193 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  27.14 
 
 
197 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  31.16 
 
 
185 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  37.33 
 
 
189 aa  54.7  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
173 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  29.71 
 
 
192 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  32.76 
 
 
230 aa  53.9  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  36.25 
 
 
184 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  36.25 
 
 
183 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  36.25 
 
 
184 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  36.25 
 
 
184 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  36.25 
 
 
184 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  29.75 
 
 
184 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  32.47 
 
 
179 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  31.16 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  26.24 
 
 
186 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  31.34 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
184 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  33.71 
 
 
195 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
188 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  33.75 
 
 
183 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.81 
 
 
180 aa  52  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
180 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  33.75 
 
 
184 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0184  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
184 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  32.47 
 
 
186 aa  50.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  33.33 
 
 
188 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  32.94 
 
 
190 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
188 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  32.91 
 
 
186 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  33.33 
 
 
188 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2828  NADPH-dependent FMN reductase  31.08 
 
 
194 aa  50.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  33.33 
 
 
188 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
188 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  35.37 
 
 
187 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  33.75 
 
 
185 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3798  NADPH-dependent FMN reductase  25.19 
 
 
202 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000652253 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
188 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
188 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
188 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
188 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
188 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
188 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  32.91 
 
 
185 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  34.57 
 
 
183 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.5 
 
 
185 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  28.21 
 
 
186 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.5 
 
 
185 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  32.5 
 
 
185 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  30.83 
 
 
187 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  27.21 
 
 
185 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.5 
 
 
185 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  26.62 
 
 
186 aa  47.4  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.5 
 
 
185 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.5 
 
 
185 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.5 
 
 
185 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  32.5 
 
 
192 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1444  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.03 
 
 
181 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  29.5 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3359  NADPH-dependent FMN reductase  29.13 
 
 
183 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.73 
 
 
187 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
184 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2299  NADPH-dependent FMN reductase  26.98 
 
 
181 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197396  hitchhiker  0.00422295 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
184 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  32.05 
 
 
186 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
197 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  24.11 
 
 
183 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  32.05 
 
 
186 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  32.5 
 
 
192 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  39.06 
 
 
176 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
182 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  26.62 
 
 
197 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 
186 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  28.06 
 
 
182 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  27.37 
 
 
183 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  27.19 
 
 
187 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
186 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>