215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0302 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0302  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  367  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247279 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3211  NADPH-dependent FMN reductase  62.21 
 
 		 173 aa  209  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.870894  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3574  hypothetical protein  61.05 
 
 		 177 aa  208  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3754  NADPH-dependent FMN reductase  61.64 
 
 		 173 aa  206  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3619  FMN reductase, NADPH-dependent  55.68 
 
 		 177 aa  206  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1015  NADPH-dependent FMN reductase  61.05 
 
 		 173 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1243  FMN reductase, NADPH-dependent  56.88 
 
 		 174 aa  196  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002868  hypothetical protein  54.07 
 
 		 174 aa  195  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.277504  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03109  hypothetical protein  53.49 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2470  NADPH-dependent FMN reductase  52.35 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.469467  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1695  hypothetical protein  48.28 
 
 		 175 aa  179  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.154497  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2657  NADPH-dependent FMN reductase  49.72 
 
 		 171 aa  177  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489341 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1037  hypothetical protein  59.09 
 
 		 132 aa  169  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09863  hypothetical protein  37.99 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2081  NADPH-dependent FMN reductase  38.06 
 
 		 180 aa  102  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  29.95 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  35.17 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  31.89 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  29.31 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  33.12 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  31.02 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  32.28 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  28.9 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  27.62 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  36.43 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  28.41 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  35.16 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  34.38 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  25.88 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  31.88 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20290  predicted flavoprotein  30.05 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.690539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  32.58 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  29.89 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  27.74 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3798  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000652253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  37.29 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  29.7 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0413  hypothetical protein  29.6 
 
 		 267 aa  61.2  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000247794  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  31.55 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 		 201 aa  60.8  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  28.4 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  28.22 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.85 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  30.25 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  31.68 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2828  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  32.54 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  26.78 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  27.93 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0432  NADPH-dependent FMN reductase  30.83 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  28.15 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  28.03 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  39.58 
 
 		 199 aa  57  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  28.57 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  35.44 
 
 		 220 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  35.79 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  29.1 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.29 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  31.39 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.29 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  31.29 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  27.56 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  27.93 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0388  NADPH-dependent FMN reductase  29.56 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.29 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  27.93 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.29 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  26.63 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.29 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.29 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  31.06 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  26.97 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  27.86 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  31.06 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0262  NADPH-dependent FMN reductase  27.94 
 
 		 403 aa  54.3  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33413  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  29.55 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  26.52 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  26.78 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0184  NADPH-dependent FMN reductase  28.34 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2534  reductase  32.43 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  28.1 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  28.1 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  28.1 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  28.1 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  28.1 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  28.1 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3359  NADPH-dependent FMN reductase  25.56 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1202  NADPH-dependent FMN reductase  32.79 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  28.1 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  26.78 
 
 		 416 aa  53.9  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  28.1 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  30.25 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  30.25 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  28.1 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  31.71 
 
 		 188 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  28.1 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  31.71 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>