143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1695 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1695  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  352  1e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.154497  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002868  hypothetical protein  73.41 
 
 		 174 aa  266  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.277504  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03109  hypothetical protein  74.14 
 
 		 174 aa  265  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3211  NADPH-dependent FMN reductase  61.27 
 
 		 173 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.870894  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1243  FMN reductase, NADPH-dependent  60.34 
 
 		 174 aa  210  9e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3574  hypothetical protein  58.38 
 
 		 177 aa  202  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2657  NADPH-dependent FMN reductase  58.38 
 
 		 171 aa  202  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489341 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3754  NADPH-dependent FMN reductase  57.86 
 
 		 173 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1015  NADPH-dependent FMN reductase  53.76 
 
 		 173 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3619  FMN reductase, NADPH-dependent  45.98 
 
 		 177 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2470  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 174 aa  176  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.469467  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1037  hypothetical protein  58.33 
 
 		 132 aa  168  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0302  hypothetical protein  48.28 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247279 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09863  hypothetical protein  38.85 
 
 		 202 aa  124  8.000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2081  NADPH-dependent FMN reductase  37.01 
 
 		 180 aa  104  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  35 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  34.11 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  28.79 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  30.3 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  32.03 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  37.11 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3359  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  34.02 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  34.69 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  26.88 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  29.8 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  27.87 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1750  flavoprotein  30.72 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.99 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  27.92 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  28.11 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  30.93 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  31.15 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  29.77 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  35.9 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  28.93 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  30.95 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  27.92 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  35.04 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2828  NADPH-dependent FMN reductase  26.09 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  30.08 
 
 		 185 aa  51.2  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  27.52 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  31.53 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  29.77 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  31.9 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.401653 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  28.83 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  28.83 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  29.66 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  28.83 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  28.22 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  28.83 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  29.31 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  28.83 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  28.83 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  28.83 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  28.83 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  28.83 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  27.08 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  31.96 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.77 
 
 		 185 aa  48.5  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  27.04 
 
 		 184 aa  48.1  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 184 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  27.93 
 
 		 188 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  27.93 
 
 		 188 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  27.93 
 
 		 188 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 184 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  27.93 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  27.93 
 
 		 188 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  26.62 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.77 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1202  NADPH-dependent FMN reductase  30.21 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.77 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  29.23 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.77 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.77 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.77 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  28.77 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.77 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3798  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000652253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4080  NADPH-dependent FMN reductase  25.99 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0440178  normal  0.0878712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  32.77 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3020  NADPH-dependent FMN reductase  28.37 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.24182  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  29.89 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  28.77 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  35.35 
 
 		 204 aa  45.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6301  NADPH-dependent FMN reductase  31.91 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  28.45 
 
 		 185 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2803  FMN reductase, NADPH-dependent  28.98 
 
 		 180 aa  44.7  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.184131  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 		 182 aa  44.7  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  27.82 
 
 		 212 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2429  NADPH-dependent FMN reductase  28.98 
 
 		 180 aa  44.7  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00496276  hitchhiker  0.0000278376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  24.73 
 
 		 193 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  27.52 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>