259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1342 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 192 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  47.42 
 
 		 203 aa  195  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  48.66 
 
 		 178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  46.32 
 
 		 198 aa  174  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  45.21 
 
 		 194 aa  160  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  46.24 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  48.94 
 
 		 227 aa  158  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  45.21 
 
 		 189 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  48.4 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  45.21 
 
 		 193 aa  154  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  42.25 
 
 		 190 aa  154  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  43.3 
 
 		 197 aa  148  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  49.46 
 
 		 205 aa  144  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  40.1 
 
 		 230 aa  144  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  40.91 
 
 		 197 aa  138  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  44.85 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  41.75 
 
 		 205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  39.29 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  40.44 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  36.61 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  36.7 
 
 		 190 aa  101  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  36.07 
 
 		 190 aa  101  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3505  NADPH-dependent FMN reductase  38.01 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.647475  normal  0.990835 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  29.35 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  31.41 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  32.8 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  36.02 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  31.05 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  34.22 
 
 		 197 aa  89.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  34.59 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  35.71 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  31.89 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  31.67 
 
 		 183 aa  85.1  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  27.98 
 
 		 188 aa  84.7  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  31.91 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  34.57 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  28.79 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  27.57 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  34.03 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  40.35 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  36.64 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  34.02 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  32.12 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  30.35 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3024  NADPH-dependent FMN reductase  31.35 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00942  hypothetical protein  29.35 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37671  predicted protein  26.51 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  33.86 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  28.43 
 
 		 197 aa  72  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  36.52 
 
 		 372 aa  72  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4165  NADPH-dependent FMN reductase  40.95 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  25.26 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  31.38 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  31.52 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  30.52 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  31.01 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  29.56 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004454  putative reductase  33.87 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.418649  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  30.32 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  29.89 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  27.23 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3838  NADPH-dependent FMN reductase  31.94 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  28.83 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2828  NADPH-dependent FMN reductase  29.86 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  28.72 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4166  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  24.53 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  29.69 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.65 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4580  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  27.95 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  28.4 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1339  NADPH-dependent FMN reductase  26.6 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  26.18 
 
 		 306 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  25.5 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  36.9 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  26.22 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  27.95 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  26.25 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  26.78 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1083  hypothetical protein  28.75 
 
 		 411 aa  53.9  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  38.39 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.99 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  30.14 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2714  NADPH-dependent FMN reductase  28 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  26.99 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  26.7 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  34.17 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  28.16 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  37.23 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  34.91 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2299  NADPH-dependent FMN reductase  26.92 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197396  hitchhiker  0.00422295 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  28.79 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  25.26 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  31.33 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  31.33 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  31.33 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  31.33 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  31.33 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>