188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0509 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
196 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  68.37 
 
 
196 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  66.33 
 
 
306 aa  270  9e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1339  NADPH-dependent FMN reductase  67.35 
 
 
196 aa  258  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4290  putative NADPH-dependent FMN reductase  65.31 
 
 
196 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  49.21 
 
 
192 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  49.21 
 
 
192 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  48.68 
 
 
192 aa  177  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  45.88 
 
 
192 aa  174  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  46.91 
 
 
192 aa  171  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  36.65 
 
 
188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  34 
 
 
219 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004454  putative reductase  33.33 
 
 
188 aa  95.9  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.418649  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  34.41 
 
 
194 aa  92  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00942  hypothetical protein  34.04 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 
185 aa  85.9  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  29.89 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  32.29 
 
 
190 aa  82  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  31.61 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  36.77 
 
 
197 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  31.41 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  31.96 
 
 
190 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2714  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  32.18 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  27.5 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  29.08 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  32.42 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  35.05 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37671  predicted protein  31.47 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  33.51 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  31.84 
 
 
187 aa  72  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  35.92 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0308  flavoprotein  36.79 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21882  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  30.93 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  25 
 
 
227 aa  67.8  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  28.5 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  26.7 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  30.15 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  27.23 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  29.15 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  30.61 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  28.43 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  30.29 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  27.08 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  31.1 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  32.7 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
197 aa  62.4  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  27.13 
 
 
189 aa  62.4  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  25.13 
 
 
188 aa  62  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  29.08 
 
 
197 aa  62  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  30.38 
 
 
188 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  30.41 
 
 
214 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
205 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  30.63 
 
 
190 aa  60.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  34.21 
 
 
209 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  32.28 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3838  NADPH-dependent FMN reductase  30.89 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  30.53 
 
 
186 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  27.34 
 
 
192 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  30.86 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  27.64 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  30.41 
 
 
230 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  28.79 
 
 
230 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  26.59 
 
 
184 aa  55.1  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  33.13 
 
 
183 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  29.19 
 
 
189 aa  54.7  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4166  NADPH-dependent FMN reductase  30.73 
 
 
190 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0533  NADPH-dependent FMN reductase  28.87 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  26.52 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  32.84 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  27.37 
 
 
350 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  23.39 
 
 
195 aa  52.4  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  24.64 
 
 
187 aa  52.4  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
197 aa  52  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  26.84 
 
 
183 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  29.38 
 
 
187 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  25.97 
 
 
372 aa  52  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  32.61 
 
 
188 aa  52  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  30.99 
 
 
183 aa  51.6  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4580  NADPH-dependent FMN reductase  29.95 
 
 
303 aa  51.6  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  33.58 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  32.35 
 
 
180 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  33.57 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  30.05 
 
 
205 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  29.79 
 
 
183 aa  51.2  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  28.95 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  29.58 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0263  NADPH-dependent FMN reductase  27.56 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.478273  normal  0.331111 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  31.69 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  26.46 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  26.9 
 
 
182 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1375  hypothetical protein  26.74 
 
 
173 aa  48.5  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.40169 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.6 
 
 
180 aa  48.5  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
192 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  29.63 
 
 
192 aa  48.5  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  25.77 
 
 
187 aa  48.5  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
197 aa  48.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>