214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5947 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
192 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  76.04 
 
 
192 aa  297  7e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  76.56 
 
 
192 aa  297  7e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  75 
 
 
192 aa  295  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  71.35 
 
 
192 aa  286  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  47.89 
 
 
188 aa  188  5e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  48.45 
 
 
196 aa  184  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1339  NADPH-dependent FMN reductase  49.73 
 
 
196 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  46.39 
 
 
306 aa  174  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  45.88 
 
 
196 aa  174  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4290  putative NADPH-dependent FMN reductase  43.81 
 
 
196 aa  147  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  33.99 
 
 
219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00942  hypothetical protein  33.71 
 
 
197 aa  104  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004454  putative reductase  35.58 
 
 
188 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.418649  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2714  NADPH-dependent FMN reductase  34.59 
 
 
223 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37671  predicted protein  34.03 
 
 
289 aa  93.2  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  31.89 
 
 
186 aa  93.6  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  29.51 
 
 
185 aa  89  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  38.42 
 
 
205 aa  86.3  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  36.02 
 
 
197 aa  85.1  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  33.85 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  34.21 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  38.94 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  31.91 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  33.68 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  30.48 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  34.03 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  32.09 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0308  flavoprotein  38.32 
 
 
125 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  31.91 
 
 
190 aa  77  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  33.85 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  31.72 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  32.26 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  33.17 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  29.95 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  29.02 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  32.45 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  36.69 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  31.77 
 
 
198 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  31.35 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
214 aa  71.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  31.77 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  30.16 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  32.89 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  29.89 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  33.85 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  30.65 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  32.07 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  31.91 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  31.06 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  34.38 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  28.22 
 
 
197 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 
201 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  28.12 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  30.91 
 
 
195 aa  63.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
192 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  37.76 
 
 
183 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  30.41 
 
 
192 aa  62.8  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  31.49 
 
 
202 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  27.86 
 
 
197 aa  62.4  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  28.87 
 
 
199 aa  61.2  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 
197 aa  61.2  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  28.14 
 
 
184 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  34.64 
 
 
181 aa  59.3  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  29.44 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 
183 aa  58.2  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  31.54 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  28.93 
 
 
230 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4580  NADPH-dependent FMN reductase  30.85 
 
 
303 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  25.17 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  27.38 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
350 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 
372 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  26.06 
 
 
187 aa  55.5  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3533  NADPH-dependent FMN reductase  24.84 
 
 
173 aa  55.1  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  30.97 
 
 
182 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  32.59 
 
 
188 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  27.84 
 
 
183 aa  54.7  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  29.61 
 
 
188 aa  54.7  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  30.82 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  32.59 
 
 
188 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  32.59 
 
 
188 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  32.59 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  32.59 
 
 
188 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3838  NADPH-dependent FMN reductase  29.9 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  30.14 
 
 
186 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  26.97 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0477  NADPH-dependent FMN reductase  34.21 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307827  normal  0.877798 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  26.97 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  32.09 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  30.67 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  30.37 
 
 
188 aa  53.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  30.67 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  32.09 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  32.09 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  32.09 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  32.19 
 
 
186 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  32.09 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>