259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1020 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
183 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  48.91 
 
 
192 aa  173  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  43.26 
 
 
186 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  41.48 
 
 
190 aa  149  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  42.78 
 
 
209 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  38.86 
 
 
187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
197 aa  131  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  37.36 
 
 
191 aa  128  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  40.91 
 
 
192 aa  127  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  37.29 
 
 
183 aa  121  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  39.66 
 
 
201 aa  108  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  40.76 
 
 
197 aa  107  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  36.67 
 
 
197 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  39.33 
 
 
194 aa  106  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  35.39 
 
 
199 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  35.2 
 
 
197 aa  101  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
190 aa  99.8  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 
195 aa  99.8  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  35.81 
 
 
197 aa  98.6  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  38.36 
 
 
194 aa  97.8  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  29.53 
 
 
178 aa  97.8  8e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  30.46 
 
 
190 aa  97.1  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  36.26 
 
 
350 aa  97.1  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4165  NADPH-dependent FMN reductase  47.42 
 
 
113 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174255  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  32.95 
 
 
188 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  31.61 
 
 
190 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  32.02 
 
 
372 aa  96.3  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  36.77 
 
 
197 aa  94  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  35.98 
 
 
214 aa  92.8  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  37.08 
 
 
189 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  36.49 
 
 
187 aa  92.8  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  33.53 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  37.34 
 
 
193 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  32.02 
 
 
203 aa  89  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  37.18 
 
 
192 aa  88.2  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  35.44 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  36.08 
 
 
189 aa  86.3  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  35.5 
 
 
230 aa  85.9  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  31.67 
 
 
192 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  32.39 
 
 
198 aa  84.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  32.96 
 
 
227 aa  84  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  32.95 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  29.83 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  33.88 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  28.99 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5059  NADPH-dependent FMN reductase  32.98 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  36.87 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3838  NADPH-dependent FMN reductase  35.36 
 
 
190 aa  74.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3505  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.647475  normal  0.990835 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  32.43 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4166  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4580  NADPH-dependent FMN reductase  35.75 
 
 
303 aa  68.6  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17270  predicted flavoprotein  33.04 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  31.1 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3024  NADPH-dependent FMN reductase  29.05 
 
 
186 aa  62.8  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  31.09 
 
 
187 aa  62  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  38.84 
 
 
194 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  32.62 
 
 
188 aa  59.7  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1339  NADPH-dependent FMN reductase  29.87 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  38.84 
 
 
188 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  38.84 
 
 
188 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  38.84 
 
 
188 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  38.02 
 
 
188 aa  59.3  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.43 
 
 
185 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  38.84 
 
 
188 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 
194 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  28.21 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03840  conserved hypothetical protein  27.34 
 
 
213 aa  58.5  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 
192 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  28.82 
 
 
184 aa  57.8  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  32.09 
 
 
183 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.41 
 
 
187 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  29.22 
 
 
196 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  29.9 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  31.33 
 
 
197 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.89 
 
 
185 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  32.8 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.89 
 
 
185 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  31.89 
 
 
185 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  37.19 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  37.19 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.89 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
306 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  37.19 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  37.19 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  29.87 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  37.19 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  37.19 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.89 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  37.19 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  28.79 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.89 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.89 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 
188 aa  55.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  36.64 
 
 
188 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>