More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1887 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 193 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  56.25 
 
 		 194 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  51.83 
 
 		 190 aa  201  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  51.05 
 
 		 227 aa  197  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  51.83 
 
 		 186 aa  188  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  51.27 
 
 		 197 aa  186  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  51.31 
 
 		 189 aa  184  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  49.21 
 
 		 202 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  52.11 
 
 		 189 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  47.4 
 
 		 203 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  54.79 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  50 
 
 		 197 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  48.98 
 
 		 205 aa  175  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  48.13 
 
 		 188 aa  174  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  47.85 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  46.84 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  44.62 
 
 		 178 aa  164  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  44.68 
 
 		 194 aa  154  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  45.21 
 
 		 192 aa  154  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  41.36 
 
 		 187 aa  138  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  38.02 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  38.83 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3505  NADPH-dependent FMN reductase  42.94 
 
 		 188 aa  111  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.647475  normal  0.990835 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  38.71 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  36.76 
 
 		 188 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  41.38 
 
 		 186 aa  104  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  36.26 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  35.9 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  36.51 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  39.1 
 
 		 372 aa  99.8  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  40.43 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  29.61 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  33 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  36.32 
 
 		 190 aa  99  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  40.43 
 
 		 350 aa  95.5  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  36.17 
 
 		 191 aa  94.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  32.8 
 
 		 188 aa  94.7  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 		 187 aa  95.1  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 		 188 aa  91.3  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  34.05 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  37.34 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  38.38 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  31.55 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  34.93 
 
 		 183 aa  88.2  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3024  NADPH-dependent FMN reductase  37.16 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  29.71 
 
 		 185 aa  85.1  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  34.21 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  34.69 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  30.51 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4165  NADPH-dependent FMN reductase  56.72 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4166  NADPH-dependent FMN reductase  37.84 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  32.31 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3838  NADPH-dependent FMN reductase  36.9 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  32.26 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  31.35 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17270  predicted flavoprotein  38.33 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4580  NADPH-dependent FMN reductase  35.26 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37671  predicted protein  32.65 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  30.81 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  30.27 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  32.7 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  39.09 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  37.1 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  32.21 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  28.43 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004454  putative reductase  28.4 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.418649  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  33.12 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  30.6 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  30.34 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  29.47 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  25.42 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  25.42 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  28.79 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  29.3 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  30.3 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  26.8 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  27.66 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  29.61 
 
 		 188 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  30.95 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  34.06 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  31.11 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0597  hypothetical protein  26.28 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0583  hypothetical protein  26.28 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.600123  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.27 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0533  NADPH-dependent FMN reductase  28.89 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  29.5 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  34.06 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  31.25 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  31.25 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  25.83 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  33.56 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  31.25 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  31.06 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>