166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4165 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4165  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 113 aa  231  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  70.27 
 
 		 191 aa  161  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  70.75 
 
 		 186 aa  155  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  63.3 
 
 		 190 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  65.09 
 
 		 197 aa  139  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  59.32 
 
 		 209 aa  136  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  64.55 
 
 		 192 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  60.38 
 
 		 187 aa  134  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  61.68 
 
 		 183 aa  126  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  47.42 
 
 		 183 aa  96.7  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  48.18 
 
 		 199 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  51.35 
 
 		 201 aa  92.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  44.55 
 
 		 194 aa  90.5  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3505  NADPH-dependent FMN reductase  49.48 
 
 		 188 aa  87.4  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.647475  normal  0.990835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  47.71 
 
 		 197 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  44.74 
 
 		 227 aa  85.1  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  45.54 
 
 		 230 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  46.3 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  56.72 
 
 		 193 aa  80.1  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  45.87 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  38.94 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  45.54 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  42.11 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  47.27 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  40.17 
 
 		 197 aa  77.4  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  51.47 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  45.71 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  41.82 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  41.67 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  37.74 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  39.82 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  42.2 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  40.87 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  44.14 
 
 		 205 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 350 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 		 192 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  36.04 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  40.95 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  44.25 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  37.74 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  55.17 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 		 372 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  41.12 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  38.32 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  38.74 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  52.63 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  36.36 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  34.51 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4166  NADPH-dependent FMN reductase  41.82 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  25.93 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  30.63 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3838  NADPH-dependent FMN reductase  40.91 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17270  predicted flavoprotein  36.36 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3024  NADPH-dependent FMN reductase  40.95 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  35.96 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  44.83 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  41.03 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 185 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 184 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  35.21 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4580  NADPH-dependent FMN reductase  37.27 
 
 		 303 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  48.44 
 
 		 184 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  48.44 
 
 		 184 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03840  conserved hypothetical protein  35.85 
 
 		 213 aa  50.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  46.88 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  46.15 
 
 		 184 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  40.32 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  38.24 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  44.62 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  43.75 
 
 		 206 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  46.88 
 
 		 183 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  44.62 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  46.55 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  46.55 
 
 		 188 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  46.55 
 
 		 188 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  46.55 
 
 		 188 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  46.55 
 
 		 194 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  34.58 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  46.55 
 
 		 188 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  44.83 
 
 		 188 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  44.62 
 
 		 183 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00942  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  43.75 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  46.88 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  46.88 
 
 		 183 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  44.83 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  45.31 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  45.31 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  44.83 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  45.31 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 		 189 aa  45.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  45.31 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  45.31 
 
 		 185 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  45.31 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  44.83 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  44.83 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  44.83 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  45.31 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>