290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0209 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 197 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  51.27 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  53.85 
 
 		 205 aa  185  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  47.21 
 
 		 190 aa  181  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  49.23 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  46.63 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  43.46 
 
 		 189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  45.31 
 
 		 197 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  47.94 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  45.69 
 
 		 230 aa  147  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  43.52 
 
 		 202 aa  147  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  41.84 
 
 		 178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  44.5 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  39.8 
 
 		 203 aa  144  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  41.58 
 
 		 214 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  40.7 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  43.98 
 
 		 189 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  40.91 
 
 		 192 aa  138  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  40.4 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  39.47 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  37.56 
 
 		 188 aa  117  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  37.25 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  34.46 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  36.17 
 
 		 188 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  34.69 
 
 		 195 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  34.76 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3505  NADPH-dependent FMN reductase  44.69 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.647475  normal  0.990835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  37.57 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  34.03 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  34.22 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  36.41 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  31.02 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  37.57 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  34.21 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  31.84 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  35.95 
 
 		 192 aa  97.1  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  32.32 
 
 		 197 aa  96.3  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  36.98 
 
 		 192 aa  95.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 		 197 aa  94.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  36.77 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  36.41 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  31.72 
 
 		 183 aa  92.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3024  NADPH-dependent FMN reductase  35.23 
 
 		 186 aa  91.7  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  32.09 
 
 		 190 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  34.9 
 
 		 372 aa  84.3  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  31.09 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 350 aa  82  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  33.51 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5059  NADPH-dependent FMN reductase  37.61 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  33.58 
 
 		 178 aa  77.8  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  28.43 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  33.85 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4165  NADPH-dependent FMN reductase  41.82 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  27.6 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3838  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  31.89 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17270  predicted flavoprotein  34.23 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4580  NADPH-dependent FMN reductase  36.79 
 
 		 303 aa  71.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4166  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  32.65 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  28.16 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  32.65 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  32.65 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  32.65 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.76 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  35.76 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.76 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.76 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  32.65 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  35.62 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.76 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.76 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  35.76 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  35.22 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.97 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  31.63 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  30.07 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  30.15 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37671  predicted protein  34.13 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  29.9 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  29.9 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  29.9 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  29.9 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2096  azobenzene reductase  32.52 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284733  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  32.26 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00942  hypothetical protein  29.41 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  29.61 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  30.96 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  30.15 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004454  putative reductase  29.01 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.418649  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  33.12 
 
 		 188 aa  62  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>