263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1545 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 203 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  47.42 
 
 		 192 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  49.74 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  47.4 
 
 		 193 aa  181  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 189 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  46.77 
 
 		 189 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  42.55 
 
 		 190 aa  157  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  39.29 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  38.42 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  43.01 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  45.21 
 
 		 205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  39.8 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  43.85 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  38.5 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  41.71 
 
 		 205 aa  138  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  42.71 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  38.62 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  38.3 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  37.97 
 
 		 187 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  34.55 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  37.23 
 
 		 190 aa  102  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  32.46 
 
 		 195 aa  101  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  34.95 
 
 		 186 aa  101  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 		 190 aa  101  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3505  NADPH-dependent FMN reductase  39.41 
 
 		 188 aa  101  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.647475  normal  0.990835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  33.67 
 
 		 197 aa  98.2  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  35.08 
 
 		 199 aa  97.8  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  27.42 
 
 		 190 aa  94.4  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  33.33 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  31.18 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  32.02 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  32.07 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  34.21 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  27.96 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  31.02 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  31.63 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  29.89 
 
 		 188 aa  84.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  32.65 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  31.98 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  27.96 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  31.02 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4165  NADPH-dependent FMN reductase  38.94 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  35.29 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  33.12 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  35.82 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  31.98 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  31.41 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  29.08 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  41.18 
 
 		 372 aa  75.5  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  30.73 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  29.02 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  31.22 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  30.73 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  35.04 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3024  NADPH-dependent FMN reductase  34.03 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  31.44 
 
 		 201 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3838  NADPH-dependent FMN reductase  33.86 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  28 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  29.11 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4580  NADPH-dependent FMN reductase  29.49 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  33.93 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  32.26 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4166  NADPH-dependent FMN reductase  34.59 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  36.21 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  26.47 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  25.13 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2828  NADPH-dependent FMN reductase  32.56 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1339  NADPH-dependent FMN reductase  27.62 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.16 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  30.48 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17270  predicted flavoprotein  29.94 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  27.96 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  27.96 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  27.5 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  26.82 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  27.96 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  31.47 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  30.54 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  30.22 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  27.93 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  31.94 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  31.94 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  31.94 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  31.94 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  31.94 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  31.94 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  31.94 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  31.94 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  29.67 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3533  NADPH-dependent FMN reductase  26.88 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.22 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  30.22 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  31.22 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  29.67 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  30.28 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>