224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4948 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 230 aa  455  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  54.08 
 
 		 186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  48.48 
 
 		 194 aa  189  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  48.47 
 
 		 190 aa  181  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 193 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  49.24 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  47.76 
 
 		 188 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  48.21 
 
 		 189 aa  165  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  47 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  51.78 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  47.26 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  45.73 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  44.88 
 
 		 202 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  48.45 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  41.54 
 
 		 178 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  46.43 
 
 		 194 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  39.29 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  45.69 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  40.1 
 
 		 192 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  45.88 
 
 		 205 aa  138  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  43.88 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3505  NADPH-dependent FMN reductase  43.17 
 
 		 188 aa  116  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.647475  normal  0.990835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  38.42 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  35.57 
 
 		 190 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  30 
 
 		 190 aa  101  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  40.64 
 
 		 187 aa  99.4  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  32.31 
 
 		 195 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  38.1 
 
 		 186 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  34.8 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  35.35 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  35.83 
 
 		 197 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3838  NADPH-dependent FMN reductase  37.31 
 
 		 190 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  34.34 
 
 		 190 aa  89.4  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  30.81 
 
 		 188 aa  89.7  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  33.51 
 
 		 192 aa  89.4  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  32.99 
 
 		 188 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3024  NADPH-dependent FMN reductase  36.87 
 
 		 186 aa  89.4  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  35.53 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 		 197 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  35.5 
 
 		 183 aa  85.9  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4165  NADPH-dependent FMN reductase  45.54 
 
 		 113 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  26.18 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  30.96 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  27.86 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4166  NADPH-dependent FMN reductase  35.32 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 350 aa  78.6  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  33.51 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  29.12 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  33.17 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  30.05 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 		 185 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  31.31 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  31.61 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 		 192 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  30.73 
 
 		 192 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  28.26 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  30.89 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17270  predicted flavoprotein  33.9 
 
 		 180 aa  68.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  33.85 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  28.5 
 
 		 306 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0633447 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  33.33 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  33.14 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  29.15 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  34.23 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37671  predicted protein  31.2 
 
 		 289 aa  62  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  24.52 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  42.22 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  34.21 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  34.9 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  34.69 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00942  hypothetical protein  31.82 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  28.79 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  39.62 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  32.05 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  31.79 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  34.07 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  41.11 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  31.79 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  31.79 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  31.79 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  31.79 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004454  putative reductase  30.3 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.418649  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  34.9 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  29.38 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2714  NADPH-dependent FMN reductase  30.57 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  41.86 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  35.63 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>