159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1363 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
306 aa  618  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  78.57 
 
 
196 aa  328  9e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4290  putative NADPH-dependent FMN reductase  76.53 
 
 
196 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1339  NADPH-dependent FMN reductase  73.98 
 
 
196 aa  295  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  66.33 
 
 
196 aa  271  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  49.23 
 
 
192 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  49.47 
 
 
192 aa  178  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
192 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  46.39 
 
 
192 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  46.39 
 
 
192 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 
188 aa  123  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  36.32 
 
 
219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00942  hypothetical protein  35.4 
 
 
197 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004454  putative reductase  34.78 
 
 
188 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.418649  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2714  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 
223 aa  93.2  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  31.96 
 
 
194 aa  89.4  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2692  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.44 
 
 
229 aa  89.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667376  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2364  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.44 
 
 
229 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal  0.206722 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1692  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.89 
 
 
224 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3909  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.53 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  30.27 
 
 
186 aa  81.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3746  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.94 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  29.19 
 
 
185 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  30.3 
 
 
197 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  29.65 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  28.87 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  28.43 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  27.67 
 
 
190 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5529  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.44 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.907506  normal  0.263855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  27.37 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5184  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.21 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4741  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.63 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0440172  normal  0.339353 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  31.32 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  32.61 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  28.79 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  29.08 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37671  predicted protein  28.5 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  28.16 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  31.82 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  28.5 
 
 
189 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  29.32 
 
 
190 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0839  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.25 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6851  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.44 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  31.72 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  29.47 
 
 
187 aa  67  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  28.5 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  26.67 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0308  flavoprotein  36.11 
 
 
125 aa  65.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21882  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 
190 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  30.77 
 
 
202 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  26.15 
 
 
197 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  32.41 
 
 
191 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  28.86 
 
 
372 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  26.47 
 
 
203 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 
192 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  31.68 
 
 
190 aa  60.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  26.8 
 
 
186 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  28.37 
 
 
187 aa  59.7  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  29.11 
 
 
230 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  27.32 
 
 
189 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  25.81 
 
 
197 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  27.84 
 
 
187 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  31.68 
 
 
197 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 
184 aa  57  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  31.37 
 
 
209 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  24.49 
 
 
195 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  26.18 
 
 
192 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  29.63 
 
 
190 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  33.04 
 
 
192 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  27.72 
 
 
201 aa  56.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 
214 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  29.32 
 
 
188 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  27.92 
 
 
183 aa  55.8  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4228  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.97 
 
 
201 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0521666 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  24.62 
 
 
193 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  30.6 
 
 
182 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  28.4 
 
 
188 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  26.49 
 
 
183 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  26.49 
 
 
183 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  27.43 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  26.77 
 
 
197 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  30.41 
 
 
205 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5221  NADPH-dependent FMN reductase  30.51 
 
 
181 aa  53.1  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.681461  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  30.38 
 
 
192 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  32.88 
 
 
184 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  26.74 
 
 
178 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  25.87 
 
 
192 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  25.14 
 
 
194 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  29.63 
 
 
181 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  29.3 
 
 
197 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  29.33 
 
 
187 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  29.08 
 
 
186 aa  49.7  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  41.67 
 
 
188 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  41.67 
 
 
188 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  41.67 
 
 
188 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  41.67 
 
 
188 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  35.96 
 
 
194 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  35.96 
 
 
188 aa  49.3  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  34.83 
 
 
188 aa  49.3  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>