45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3909 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_3909  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
219 aa  441  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2692  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.12 
 
 
229 aa  310  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667376  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2364  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.28 
 
 
229 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal  0.206722 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0839  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.28 
 
 
230 aa  293  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3746  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.28 
 
 
224 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1692  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.56 
 
 
224 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6851  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.73 
 
 
222 aa  244  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5529  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.66 
 
 
222 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.907506  normal  0.263855 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5184  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.68 
 
 
213 aa  235  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4228  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.14 
 
 
201 aa  228  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0521666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4741  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.36 
 
 
201 aa  211  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0440172  normal  0.339353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2169  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.35 
 
 
166 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1057  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.73 
 
 
226 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6830  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.05 
 
 
180 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0846161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7132  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.42 
 
 
148 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1362  hypothetical protein  60.91 
 
 
187 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2860  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.39 
 
 
150 aa  119  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0904  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.57 
 
 
123 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4618  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.44 
 
 
134 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0216578  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2049  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.06 
 
 
137 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0699127  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2942  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.79 
 
 
137 aa  105  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1037  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.84 
 
 
130 aa  105  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0648  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.07 
 
 
125 aa  104  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5729  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.4 
 
 
127 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.574413  normal  0.799624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1145  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.41 
 
 
124 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0322749  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21190  lactoylglutathione lyase family protein  39.04 
 
 
123 aa  96.3  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0790375 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2107  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.13 
 
 
137 aa  94  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00805691  normal  0.0254617 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0801  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.82 
 
 
122 aa  92.4  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0362  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.67 
 
 
137 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8719  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.85 
 
 
135 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1392  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.54 
 
 
152 aa  87  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1403  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.79 
 
 
152 aa  85.1  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5221  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.67 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0278  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.62 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.314821  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  60.53 
 
 
306 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16350  hypothetical protein  28.08 
 
 
127 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300608  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2316  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.14 
 
 
119 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3839  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
138 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1275  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.26 
 
 
121 aa  48.5  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350452  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5113  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.14 
 
 
151 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.781914  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0978  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.56 
 
 
127 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1787  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.26 
 
 
130 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0936507  hitchhiker  0.00512578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2577  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 
123 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1490  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.48 
 
 
117 aa  42.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.532313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0118  Proline racemase  32.61 
 
 
345 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>