151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0118 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0118  Proline racemase  100 
 
 		 345 aa  703    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0107  proline racemase  97.1 
 
 		 345 aa  686    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0518  hypothetical protein  76.81 
 
 		 347 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5268  proline racemase  58.82 
 
 		 348 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3225  proline racemase  58.31 
 
 		 348 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.821364 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4845  proline racemase  55.88 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1587  proline racemase  54.87 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1045  proline racemase  43.27 
 
 		 340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4137  hypothetical protein  40.94 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.583896  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3201  proline racemase  41.11 
 
 		 341 aa  271  8.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0659896  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3861  proline racemase  41.98 
 
 		 342 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.438551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47970  hypothetical protein  40.06 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.301488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3320  proline racemase  43.62 
 
 		 336 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1529  proline racemase  40.94 
 
 		 346 aa  261  8.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0477377  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_004310  BR0337  proline racemase, putative  40.06 
 
 		 342 aa  260  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0353  putative proline racemase  40.06 
 
 		 342 aa  260  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.928096  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0439  proline racemase  39.47 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1184  proline racemase  39.77 
 
 		 342 aa  255  9e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2117  proline racemase  39.77 
 
 		 348 aa  253  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.231531 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7022  hypothetical protein  38.6 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283298  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2641  proline racemase  37.03 
 
 		 342 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0234  proline racemase  38.07 
 
 		 350 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4111  Proline racemase  39.4 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4722  proline racemase  39.58 
 
 		 333 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31580  proline racemase  40.3 
 
 		 333 aa  227  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5915  proline racemase  40.41 
 
 		 333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314959  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3503  Proline racemase  40.48 
 
 		 333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2259  proline racemase  38.64 
 
 		 337 aa  222  9e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6004  4-hydroxyproline epimerase  39.58 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.0460941 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2594  proline racemase  35.71 
 
 		 345 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2447  putative proline racemase  35.71 
 
 		 345 aa  212  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2559  proline racemase  35.71 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2885  putative proline racemase  35.42 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2840  putative proline racemase  35.42 
 
 		 345 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000647776 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2637  proline racemase  35.71 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2643  proline racemase  35.12 
 
 		 345 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2834  proline racemase  35.12 
 
 		 345 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2846  putative proline racemase  35.42 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0498  proline racemase  33.73 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2863  proline racemase, putative  35.64 
 
 		 312 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0431348  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4260  proline racemase  33.23 
 
 		 335 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0642  proline racemase  33.63 
 
 		 351 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2363  hydroxyproline-2-epimerase  33.63 
 
 		 333 aa  182  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00996894  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5694  proline racemase  32.34 
 
 		 335 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4243  proline racemase  33.23 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000241278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1660  proline racemase  32.93 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000137069  normal  0.0715412 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4007  proline racemase  32.93 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3769  proline racemase  33.23 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00125754  normal  0.197113 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4360  proline racemase  32.93 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2141  proline racemase  34.23 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5994  proline racemase  32.63 
 
 		 335 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1792  hydroxyproline-2-epimerase  33.43 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1726  hydroxyproline-2-epimerase  33.43 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.716077  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1024  putative proline racemase  32.63 
 
 		 335 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0744753 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1082  putative proline racemase  33.33 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2339  proline racemase  31.93 
 
 		 361 aa  177  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04640  proline racemase  33.43 
 
 		 343 aa  176  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0989  putative proline racemase  32.74 
 
 		 331 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0492400000000001e-61 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1478  4-hydroxyproline epimerase  32.52 
 
 		 334 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.857006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2823  hydroxyproline-2-epimerase  31.74 
 
 		 333 aa  175  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  normal  0.582579 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0994  proline racemase, putative  33.33 
 
 		 334 aa  175  9e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0853  proline racemase  33.63 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0901  proline racemase  33.63 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.699009  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1530  hydroxyproline-2-epimerase  32.13 
 
 		 333 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1111  hydroxyproline-2-epimerase  32.54 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920734  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0460  Proline racemase  32.24 
 
 		 336 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4388  putative proline racemase  32.44 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.208598  hitchhiker  1.6490700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0802  proline racemase  32.14 
 
 		 331 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0943  putative proline racemase  32.44 
 
 		 334 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0120446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0800  proline racemase  32.14 
 
 		 334 aa  169  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0799  proline racemase  31.85 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5572  hydroxyproline-2-epimerase  32.54 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000335762  normal  0.0993584 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3863  hydroxyproline-2-epimerase  32.13 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.365358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1703  hydroxyproline-2-epimerase  31.14 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129643  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1450  hydroxyproline-2-epimerase  33.11 
 
 		 305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1419  hydroxyproline-2-epimerase  32.63 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0468879  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1761  hydroxyproline-2-epimerase  30.24 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000415144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1690  proline racemase  30.27 
 
 		 335 aa  162  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3344  proline racemase  31.44 
 
 		 335 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0227164 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2065  hydroxyproline-2-epimerase  30.54 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.012514  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4273  hydroxyproline-2-epimerase  32.24 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2251  proline racemase  30.45 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2058  proline racemase  31.12 
 
 		 365 aa  159  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272833 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0298  hydroxyproline-2-epimerase  30.33 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.123258 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003673  4-hydroxyproline epimerase  30.45 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3228  hydroxyproline-2-epimerase  32.34 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.771447 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4841  hydroxyproline-2-epimerase  30.63 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122801 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4859  hydroxyproline-2-epimerase  31.91 
 
 		 334 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3463  hydroxyproline-2-epimerase  31.39 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5997  Proline racemase  31.58 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.720935  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3467  hydroxyproline-2-epimerase  33.03 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5285  hydroxyproline-2-epimerase  30.33 
 
 		 332 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103378  normal  0.295156 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2361  proline racemase  29.82 
 
 		 346 aa  149  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000418015  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1705  proline racemase  30 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.360365  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5265  hydroxyproline-2-epimerase  32.42 
 
 		 338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1532  putative proline racemase  31.34 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2317  Proline racemase  30.84 
 
 		 338 aa  145  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3966  proline racemase  30.33 
 
 		 323 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3837  proline racemase  30.33 
 
 		 323 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1453  putative proline racemase  29.61 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.67245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>