150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2141 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2141  proline racemase  100 
 
 		 351 aa  715    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2339  proline racemase  76.57 
 
 		 361 aa  555  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04640  proline racemase  51.75 
 
 		 343 aa  349  4e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2058  proline racemase  51.34 
 
 		 365 aa  328  7e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272833 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1184  proline racemase  37.05 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3201  proline racemase  34.74 
 
 		 341 aa  209  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0659896  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2641  proline racemase  35.84 
 
 		 342 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3861  proline racemase  35.05 
 
 		 342 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.438551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1045  proline racemase  34.74 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47970  hypothetical protein  33.84 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.301488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7022  hypothetical protein  34.74 
 
 		 342 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283298  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4137  hypothetical protein  33.84 
 
 		 344 aa  198  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.583896  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5268  proline racemase  34.14 
 
 		 348 aa  198  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3225  proline racemase  33.23 
 
 		 348 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.821364 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1529  proline racemase  34.34 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0477377  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0518  hypothetical protein  33.93 
 
 		 347 aa  189  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0234  proline racemase  33.72 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1587  proline racemase  35.52 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0439  proline racemase  32.93 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2117  proline racemase  32.63 
 
 		 348 aa  186  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.231531 
 
 
-
 
NC_004310  BR0337  proline racemase, putative  32.02 
 
 		 342 aa  183  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0353  putative proline racemase  31.72 
 
 		 342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.928096  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0118  Proline racemase  34.23 
 
 		 345 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0107  proline racemase  34.53 
 
 		 345 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3503  Proline racemase  31.72 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4722  proline racemase  33.33 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31580  proline racemase  32.4 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5915  proline racemase  32.02 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314959  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4111  Proline racemase  30.82 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6004  4-hydroxyproline epimerase  32.02 
 
 		 333 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.0460941 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4845  proline racemase  30.98 
 
 		 344 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2259  proline racemase  30.72 
 
 		 337 aa  159  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755409  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0642  proline racemase  28.88 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2559  proline racemase  29.31 
 
 		 345 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2885  putative proline racemase  30.42 
 
 		 345 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2643  proline racemase  30.42 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2834  proline racemase  30.42 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2594  proline racemase  30.12 
 
 		 345 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2840  putative proline racemase  30.12 
 
 		 345 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000647776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2846  putative proline racemase  30.12 
 
 		 345 aa  150  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3320  proline racemase  30.56 
 
 		 336 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2447  putative proline racemase  29.94 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2637  proline racemase  30.72 
 
 		 345 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1453  putative proline racemase  28.18 
 
 		 355 aa  136  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.67245  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1690  proline racemase  29.75 
 
 		 335 aa  135  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5694  proline racemase  28.45 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3467  hydroxyproline-2-epimerase  30.45 
 
 		 333 aa  133  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1419  hydroxyproline-2-epimerase  29.36 
 
 		 332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0468879  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2251  proline racemase  27.36 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1024  putative proline racemase  28.74 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0744753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2863  proline racemase, putative  30.41 
 
 		 312 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0431348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0989  putative proline racemase  28.92 
 
 		 331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0492400000000001e-61 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0498  proline racemase  29.34 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4841  hydroxyproline-2-epimerase  29.94 
 
 		 332 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122801 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1478  4-hydroxyproline epimerase  29.31 
 
 		 334 aa  125  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.857006  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1792  hydroxyproline-2-epimerase  29.01 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4273  hydroxyproline-2-epimerase  29.19 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7251  hydroxyproline-2-epimerase  29.94 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2361  proline racemase  26.23 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000418015  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1726  hydroxyproline-2-epimerase  29.01 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.716077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4388  putative proline racemase  28.01 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.208598  hitchhiker  1.6490700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0800  proline racemase  28.1 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0943  putative proline racemase  27.71 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0120446  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1660  proline racemase  29.15 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000137069  normal  0.0715412 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4007  proline racemase  29.15 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4360  proline racemase  29.15 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1111  hydroxyproline-2-epimerase  29.27 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920734  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5994  proline racemase  29.15 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1530  hydroxyproline-2-epimerase  28.83 
 
 		 333 aa  123  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0994  proline racemase, putative  28.01 
 
 		 334 aa  123  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5285  hydroxyproline-2-epimerase  29.34 
 
 		 332 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103378  normal  0.295156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3463  hydroxyproline-2-epimerase  30.97 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0802  proline racemase  28.31 
 
 		 331 aa  122  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0853  proline racemase  28.01 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0901  proline racemase  28.01 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.699009  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3769  proline racemase  28.86 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00125754  normal  0.197113 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0799  proline racemase  27.79 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4243  proline racemase  28.86 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000241278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2065  hydroxyproline-2-epimerase  28.19 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.012514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1082  putative proline racemase  27.19 
 
 		 334 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4260  proline racemase  29.12 
 
 		 335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3966  proline racemase  27.6 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3863  hydroxyproline-2-epimerase  27.22 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.365358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2363  hydroxyproline-2-epimerase  27.61 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00996894  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1532  putative proline racemase  27.06 
 
 		 346 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0460  Proline racemase  26.6 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1703  hydroxyproline-2-epimerase  27.38 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129643  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0298  hydroxyproline-2-epimerase  27.78 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.123258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3837  proline racemase  27.71 
 
 		 323 aa  113  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3344  proline racemase  26.98 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0227164 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1763  proline racemase  26.38 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000615926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5572  hydroxyproline-2-epimerase  27.38 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000335762  normal  0.0993584 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4859  hydroxyproline-2-epimerase  28.7 
 
 		 334 aa  109  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2823  hydroxyproline-2-epimerase  27.19 
 
 		 333 aa  109  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  normal  0.582579 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1761  hydroxyproline-2-epimerase  28.1 
 
 		 333 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000415144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1705  proline racemase  26.46 
 
 		 346 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.360365  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2499  proline racemase  28.35 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.293711  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4133  proline racemase  29.14 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2821  proline racemase  26.27 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1219  proline racemase  25.44 
 
 		 332 aa  105  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>