150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2339 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2339  proline racemase  100 
 
 		 361 aa  731    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2141  proline racemase  76.57 
 
 		 351 aa  555  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04640  proline racemase  52.92 
 
 		 343 aa  356  2.9999999999999997e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2058  proline racemase  51.01 
 
 		 365 aa  334  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272833 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3861  proline racemase  36.04 
 
 		 342 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.438551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2641  proline racemase  34.18 
 
 		 342 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1184  proline racemase  33.05 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1045  proline racemase  35.69 
 
 		 340 aa  205  9e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1529  proline racemase  35.44 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0477377  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0439  proline racemase  32.95 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3201  proline racemase  34.23 
 
 		 341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0659896  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47970  hypothetical protein  32.75 
 
 		 344 aa  195  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.301488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0234  proline racemase  34.94 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5268  proline racemase  33.23 
 
 		 348 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2117  proline racemase  31.74 
 
 		 348 aa  193  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.231531 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7022  hypothetical protein  33.84 
 
 		 342 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283298  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4137  hypothetical protein  32.46 
 
 		 344 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.583896  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0337  proline racemase, putative  31.27 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0353  putative proline racemase  30.99 
 
 		 342 aa  186  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.928096  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3225  proline racemase  31.12 
 
 		 348 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.821364 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31580  proline racemase  34.26 
 
 		 333 aa  185  9e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1587  proline racemase  33.84 
 
 		 338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0518  hypothetical protein  32.43 
 
 		 347 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4111  Proline racemase  31.72 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0118  Proline racemase  31.93 
 
 		 345 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0107  proline racemase  32.23 
 
 		 345 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4722  proline racemase  33.96 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3503  Proline racemase  31.42 
 
 		 333 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6004  4-hydroxyproline epimerase  31.83 
 
 		 333 aa  169  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.0460941 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4845  proline racemase  29.61 
 
 		 344 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5915  proline racemase  31.12 
 
 		 333 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314959  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2259  proline racemase  30.72 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755409  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0642  proline racemase  30.21 
 
 		 351 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2447  putative proline racemase  30.65 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2885  putative proline racemase  30.54 
 
 		 345 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2637  proline racemase  30.84 
 
 		 345 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2846  putative proline racemase  29.94 
 
 		 345 aa  152  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2559  proline racemase  29.94 
 
 		 345 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2643  proline racemase  30.24 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2834  proline racemase  30.24 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2594  proline racemase  29.94 
 
 		 345 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2840  putative proline racemase  29.94 
 
 		 345 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000647776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3320  proline racemase  29.63 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2251  proline racemase  28.53 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1478  4-hydroxyproline epimerase  29.82 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.857006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1690  proline racemase  29.85 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4273  hydroxyproline-2-epimerase  30.65 
 
 		 333 aa  132  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1792  hydroxyproline-2-epimerase  29.41 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1726  hydroxyproline-2-epimerase  29.41 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.716077  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1660  proline racemase  27.68 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000137069  normal  0.0715412 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0498  proline racemase  30.37 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3769  proline racemase  27.68 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00125754  normal  0.197113 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4243  proline racemase  27.68 
 
 		 335 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000241278  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2863  proline racemase, putative  29.77 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0431348  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1111  hydroxyproline-2-epimerase  29.97 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920734  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1453  putative proline racemase  26.3 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.67245  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5994  proline racemase  27.38 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4007  proline racemase  27.38 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4360  proline racemase  27.38 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4260  proline racemase  27.46 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5572  hydroxyproline-2-epimerase  30.46 
 
 		 333 aa  126  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000335762  normal  0.0993584 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4841  hydroxyproline-2-epimerase  29.08 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122801 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5694  proline racemase  28.11 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1419  hydroxyproline-2-epimerase  28.88 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0468879  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3863  hydroxyproline-2-epimerase  28.75 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.365358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3966  proline racemase  29.79 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5285  hydroxyproline-2-epimerase  28.78 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103378  normal  0.295156 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1024  putative proline racemase  26.49 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0744753 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0989  putative proline racemase  28.17 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0492400000000001e-61 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1530  hydroxyproline-2-epimerase  27.52 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1703  hydroxyproline-2-epimerase  27.08 
 
 		 333 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0800  proline racemase  28 
 
 		 334 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4388  putative proline racemase  26.93 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.208598  hitchhiker  1.6490700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3467  hydroxyproline-2-epimerase  30.06 
 
 		 333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0853  proline racemase  26.27 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0901  proline racemase  26.27 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.699009  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2361  proline racemase  26.46 
 
 		 346 aa  116  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000418015  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0994  proline racemase, putative  26.71 
 
 		 334 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2823  hydroxyproline-2-epimerase  27.22 
 
 		 333 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  normal  0.582579 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2363  hydroxyproline-2-epimerase  27.61 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00996894  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0943  putative proline racemase  26.93 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0120446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1082  putative proline racemase  26.71 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7251  hydroxyproline-2-epimerase  29.29 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3463  hydroxyproline-2-epimerase  31.6 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0799  proline racemase  26.11 
 
 		 334 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0802  proline racemase  27.24 
 
 		 331 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3344  proline racemase  25.3 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0227164 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1532  putative proline racemase  28.93 
 
 		 346 aa  112  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5997  Proline racemase  30.58 
 
 		 336 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.720935  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0460  Proline racemase  27.27 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1761  hydroxyproline-2-epimerase  26.38 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000415144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3837  proline racemase  28.14 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4667  proline racemase  29.22 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  0.66467 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1705  proline racemase  29.32 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.360365  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2065  hydroxyproline-2-epimerase  26.63 
 
 		 333 aa  109  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.012514  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1763  proline racemase  27.78 
 
 		 346 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000615926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3975  proline racemase  29.52 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834957  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3164  proline racemase  27.41 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3519  putative proline racemase  27.41 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.235332  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4859  hydroxyproline-2-epimerase  28.4 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>