150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3164 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3519  putative proline racemase  99.41 
 
 		 337 aa  690    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.235332  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3164  proline racemase  100 
 
 		 337 aa  695    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2559  proline racemase  37.87 
 
 		 345 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2594  proline racemase  37.57 
 
 		 345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2885  putative proline racemase  37.28 
 
 		 345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2637  proline racemase  37.28 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2840  putative proline racemase  37.28 
 
 		 345 aa  232  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000647776 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2643  proline racemase  36.98 
 
 		 345 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2834  proline racemase  36.98 
 
 		 345 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2846  putative proline racemase  36.98 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0642  proline racemase  36.28 
 
 		 351 aa  222  8e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2447  putative proline racemase  36.69 
 
 		 345 aa  222  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2259  proline racemase  36.61 
 
 		 337 aa  219  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755409  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5694  proline racemase  35.91 
 
 		 335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3503  Proline racemase  37.69 
 
 		 333 aa  215  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1024  putative proline racemase  35.61 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0744753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4722  proline racemase  37.91 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5915  proline racemase  37.69 
 
 		 333 aa  212  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314959  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31580  proline racemase  37.98 
 
 		 333 aa  212  9e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3344  proline racemase  34.72 
 
 		 335 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0227164 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1453  putative proline racemase  36.47 
 
 		 355 aa  209  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.67245  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1660  proline racemase  35.01 
 
 		 335 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000137069  normal  0.0715412 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0853  proline racemase  34.62 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0901  proline racemase  34.62 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.699009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0989  putative proline racemase  34.62 
 
 		 331 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0492400000000001e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0802  proline racemase  34.62 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2863  proline racemase, putative  35.97 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0431348  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3769  proline racemase  34.72 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00125754  normal  0.197113 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1419  hydroxyproline-2-epimerase  34.03 
 
 		 332 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0468879  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0943  putative proline racemase  33.93 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0120446  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2363  hydroxyproline-2-epimerase  34.03 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00996894  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4260  proline racemase  34.42 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4111  Proline racemase  35.82 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4388  putative proline racemase  33.93 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.208598  hitchhiker  1.6490700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4243  proline racemase  34.12 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000241278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6004  4-hydroxyproline epimerase  37.09 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.0460941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1761  hydroxyproline-2-epimerase  33.93 
 
 		 333 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000415144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1082  putative proline racemase  34.82 
 
 		 334 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5994  proline racemase  34.12 
 
 		 335 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1530  hydroxyproline-2-epimerase  34.03 
 
 		 333 aa  202  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1703  hydroxyproline-2-epimerase  32.84 
 
 		 333 aa  202  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129643  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4007  proline racemase  33.83 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4360  proline racemase  33.83 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0994  proline racemase, putative  33.93 
 
 		 334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0799  proline racemase  34.52 
 
 		 334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2823  hydroxyproline-2-epimerase  32.54 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  normal  0.582579 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0800  proline racemase  33.63 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4859  hydroxyproline-2-epimerase  34.73 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0234  proline racemase  33.91 
 
 		 350 aa  192  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5268  proline racemase  33.83 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2065  hydroxyproline-2-epimerase  32.43 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.012514  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2251  proline racemase  32.83 
 
 		 335 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1532  putative proline racemase  34.15 
 
 		 346 aa  186  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1478  4-hydroxyproline epimerase  32.23 
 
 		 334 aa  185  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.857006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4273  hydroxyproline-2-epimerase  32.74 
 
 		 333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0298  hydroxyproline-2-epimerase  31.14 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.123258 
 
 
-
 
NC_004310  BR1792  hydroxyproline-2-epimerase  33.33 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5572  hydroxyproline-2-epimerase  34.23 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000335762  normal  0.0993584 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2361  proline racemase  32.93 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000418015  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1726  hydroxyproline-2-epimerase  33.33 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.716077  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2821  proline racemase  32.42 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003673  4-hydroxyproline epimerase  34.22 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1111  hydroxyproline-2-epimerase  34.15 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920734  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3225  proline racemase  33.23 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.821364 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4845  proline racemase  34.45 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0460  Proline racemase  33.23 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1705  proline racemase  31.71 
 
 		 346 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.360365  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1690  proline racemase  33.04 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5997  Proline racemase  36.07 
 
 		 336 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.720935  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1763  proline racemase  31.38 
 
 		 346 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000615926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3467  hydroxyproline-2-epimerase  31.42 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3863  hydroxyproline-2-epimerase  31.72 
 
 		 333 aa  173  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.365358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3228  hydroxyproline-2-epimerase  31.31 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.771447 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1045  proline racemase  31.66 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1450  hydroxyproline-2-epimerase  32.24 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0498  proline racemase  31.72 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7251  hydroxyproline-2-epimerase  30.91 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3463  hydroxyproline-2-epimerase  32.04 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5285  hydroxyproline-2-epimerase  29.04 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103378  normal  0.295156 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2317  Proline racemase  31.31 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5265  hydroxyproline-2-epimerase  30.3 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4841  hydroxyproline-2-epimerase  28.96 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122801 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3861  proline racemase  29.38 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.438551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3837  proline racemase  30.68 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1184  proline racemase  28.7 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1894  hydroxyproline-2-epimerase  33.13 
 
 		 359 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321718 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1587  proline racemase  30.18 
 
 		 338 aa  146  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3379  hydroxyproline-2-epimerase  33.75 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3966  proline racemase  29.79 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47970  hypothetical protein  28.99 
 
 		 344 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.301488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4447  hydroxyproline-2-epimerase  32.83 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7022  hypothetical protein  28.19 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283298  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4226  hydroxyproline-2-epimerase  33.44 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068092  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4140  hydroxyproline-2-epimerase  33.44 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.465204  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2641  proline racemase  26.76 
 
 		 342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5220  4-hydroxyproline epimerase  32.61 
 
 		 312 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0432032  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4137  hypothetical protein  27.98 
 
 		 344 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.583896  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0439  proline racemase  27.3 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4667  proline racemase  29.48 
 
 		 344 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  0.66467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0118  Proline racemase  30.56 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>