167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1450 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1450  hydroxyproline-2-epimerase  100 
 
 		 305 aa  632  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2823  hydroxyproline-2-epimerase  70.72 
 
 		 333 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  normal  0.582579 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2363  hydroxyproline-2-epimerase  69.74 
 
 		 333 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00996894  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1761  hydroxyproline-2-epimerase  70.39 
 
 		 333 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000415144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1530  hydroxyproline-2-epimerase  68.75 
 
 		 333 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1703  hydroxyproline-2-epimerase  69.41 
 
 		 333 aa  455  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129643  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003673  4-hydroxyproline epimerase  64.59 
 
 		 301 aa  421  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1478  4-hydroxyproline epimerase  59.54 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.857006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0498  proline racemase  57.89 
 
 		 333 aa  374  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1111  hydroxyproline-2-epimerase  56.91 
 
 		 337 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1792  hydroxyproline-2-epimerase  58.22 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1726  hydroxyproline-2-epimerase  58.22 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.716077  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5572  hydroxyproline-2-epimerase  57.7 
 
 		 333 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000335762  normal  0.0993584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4273  hydroxyproline-2-epimerase  57.7 
 
 		 333 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3863  hydroxyproline-2-epimerase  54.75 
 
 		 333 aa  357  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.365358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0298  hydroxyproline-2-epimerase  56.58 
 
 		 332 aa  355  3.9999999999999996e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.123258 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4859  hydroxyproline-2-epimerase  53.92 
 
 		 334 aa  347  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1419  hydroxyproline-2-epimerase  52.46 
 
 		 332 aa  342  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0468879  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5285  hydroxyproline-2-epimerase  50.82 
 
 		 332 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103378  normal  0.295156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3463  hydroxyproline-2-epimerase  53.93 
 
 		 308 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4841  hydroxyproline-2-epimerase  49.18 
 
 		 332 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122801 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2065  hydroxyproline-2-epimerase  50.99 
 
 		 333 aa  322  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.012514  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3228  hydroxyproline-2-epimerase  48.2 
 
 		 338 aa  318  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.771447 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7251  hydroxyproline-2-epimerase  49.51 
 
 		 332 aa  315  8e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3467  hydroxyproline-2-epimerase  49.83 
 
 		 333 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5265  hydroxyproline-2-epimerase  47.21 
 
 		 338 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2259  proline racemase  39.02 
 
 		 337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755409  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5915  proline racemase  42.16 
 
 		 333 aa  229  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314959  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6004  4-hydroxyproline epimerase  42.43 
 
 		 333 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.0460941 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31580  proline racemase  41.78 
 
 		 333 aa  226  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3503  Proline racemase  41.64 
 
 		 333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4722  proline racemase  42.48 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2447  putative proline racemase  38.28 
 
 		 345 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2846  putative proline racemase  38.28 
 
 		 345 aa  215  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4111  Proline racemase  38.03 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650339  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2559  proline racemase  36.96 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2885  putative proline racemase  37.29 
 
 		 345 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2863  proline racemase, putative  37.62 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0431348  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2594  proline racemase  36.96 
 
 		 345 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2643  proline racemase  36.96 
 
 		 345 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2834  proline racemase  36.96 
 
 		 345 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2637  proline racemase  37.95 
 
 		 345 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2840  putative proline racemase  36.96 
 
 		 345 aa  211  9e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000647776 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1690  proline racemase  41.1 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0853  proline racemase  35 
 
 		 331 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0901  proline racemase  35 
 
 		 331 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.699009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0989  putative proline racemase  34.67 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0492400000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0943  putative proline racemase  34.22 
 
 		 334 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0120446  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5694  proline racemase  35.41 
 
 		 335 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4388  putative proline racemase  33.55 
 
 		 334 aa  189  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.208598  hitchhiker  1.6490700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0460  Proline racemase  35.16 
 
 		 336 aa  188  9e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4007  proline racemase  33.88 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4360  proline racemase  33.88 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0802  proline racemase  33.67 
 
 		 331 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1660  proline racemase  33.55 
 
 		 335 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000137069  normal  0.0715412 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1082  putative proline racemase  33.99 
 
 		 334 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0800  proline racemase  34.32 
 
 		 334 aa  186  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3769  proline racemase  33.55 
 
 		 335 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00125754  normal  0.197113 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4243  proline racemase  33.55 
 
 		 335 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000241278  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0994  proline racemase, putative  34.32 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5994  proline racemase  33.22 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0799  proline racemase  33 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4260  proline racemase  33.22 
 
 		 335 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1024  putative proline racemase  32.89 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0744753 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1045  proline racemase  32.79 
 
 		 340 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0642  proline racemase  31.82 
 
 		 351 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3164  proline racemase  32.24 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0234  proline racemase  33.44 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0118  Proline racemase  33.11 
 
 		 345 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3519  putative proline racemase  31.91 
 
 		 337 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.235332  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3344  proline racemase  29.28 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0227164 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2251  proline racemase  31.07 
 
 		 335 aa  162  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1258  proline racemase  34.77 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.687008 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4667  proline racemase  35.31 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  0.66467 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4845  proline racemase  31.06 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4133  proline racemase  34.11 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47840  hypothetical protein  35.1 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000281004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0107  proline racemase  32.08 
 
 		 345 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2308  proline racemase  34.11 
 
 		 308 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.346868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1285  proline racemase  33.77 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.753668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4122  hypothetical protein  35.43 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0159506  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2705  proline racemase  35.31 
 
 		 311 aa  155  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2713  4-hydroxyproline epimerase  31.35 
 
 		 359 aa  155  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5268  proline racemase  31.68 
 
 		 348 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2317  Proline racemase  30.57 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3225  proline racemase  30.36 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.821364 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1840  proline racemase  33.44 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1044  proline racemase  33.12 
 
 		 317 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47970  hypothetical protein  32.33 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.301488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4137  hypothetical protein  32.67 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.583896  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1219  proline racemase  30.84 
 
 		 332 aa  142  8e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3320  proline racemase  30.59 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4447  hydroxyproline-2-epimerase  32.67 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0337  proline racemase, putative  32.33 
 
 		 342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0353  putative proline racemase  32.67 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.928096  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0439  proline racemase  32 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3379  hydroxyproline-2-epimerase  33 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4226  hydroxyproline-2-epimerase  33 
 
 		 359 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068092  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4140  hydroxyproline-2-epimerase  33 
 
 		 359 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.465204  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5220  4-hydroxyproline epimerase  32.89 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0432032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>