150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0234 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0234  proline racemase  100 
 
 		 350 aa  719    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1045  proline racemase  50.57 
 
 		 340 aa  353  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4137  hypothetical protein  43.47 
 
 		 344 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.583896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47970  hypothetical protein  43.18 
 
 		 344 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.301488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3861  proline racemase  43.14 
 
 		 342 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.438551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2259  proline racemase  42.36 
 
 		 337 aa  276  5e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755409  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0439  proline racemase  42.86 
 
 		 343 aa  276  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2641  proline racemase  43.47 
 
 		 342 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3201  proline racemase  40.62 
 
 		 341 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0659896  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1529  proline racemase  42 
 
 		 346 aa  270  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0477377  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_004310  BR0337  proline racemase, putative  42.29 
 
 		 342 aa  269  5.9999999999999995e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0353  putative proline racemase  42 
 
 		 342 aa  268  8e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.928096  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2594  proline racemase  39.83 
 
 		 345 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2559  proline racemase  39.53 
 
 		 345 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2840  putative proline racemase  39.83 
 
 		 345 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000647776 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2643  proline racemase  39.83 
 
 		 345 aa  266  4e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2834  proline racemase  39.83 
 
 		 345 aa  266  4e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4111  Proline racemase  42.49 
 
 		 333 aa  266  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2637  proline racemase  39.83 
 
 		 345 aa  266  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2885  putative proline racemase  39.24 
 
 		 345 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1184  proline racemase  41.19 
 
 		 342 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5268  proline racemase  39.14 
 
 		 348 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3225  proline racemase  39.43 
 
 		 348 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.821364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5915  proline racemase  42.2 
 
 		 333 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314959  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7022  hypothetical protein  40.17 
 
 		 342 aa  262  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6004  4-hydroxyproline epimerase  43.31 
 
 		 333 aa  262  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.0460941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3503  Proline racemase  41.91 
 
 		 333 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31580  proline racemase  42.29 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4722  proline racemase  41.6 
 
 		 333 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2447  putative proline racemase  38.08 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2846  putative proline racemase  38.08 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1587  proline racemase  39.71 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2117  proline racemase  37.71 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.231531 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0118  Proline racemase  38.07 
 
 		 345 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1690  proline racemase  38.84 
 
 		 335 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0107  proline racemase  37.5 
 
 		 345 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2863  proline racemase, putative  39.55 
 
 		 312 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0431348  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0518  hypothetical protein  37.5 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4845  proline racemase  36.95 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0642  proline racemase  35.36 
 
 		 351 aa  225  9e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2823  hydroxyproline-2-epimerase  37.21 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  normal  0.582579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3320  proline racemase  35.16 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0498  proline racemase  37.21 
 
 		 333 aa  215  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1761  hydroxyproline-2-epimerase  36.92 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000415144  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0994  proline racemase, putative  35.73 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04640  proline racemase  36.73 
 
 		 343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1082  putative proline racemase  35.45 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0800  proline racemase  35.47 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0989  putative proline racemase  35.45 
 
 		 331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0492400000000001e-61 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2363  hydroxyproline-2-epimerase  36.34 
 
 		 333 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00996894  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1530  hydroxyproline-2-epimerase  36.34 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1792  hydroxyproline-2-epimerase  35.8 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0799  proline racemase  34.87 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4388  putative proline racemase  34.58 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.208598  hitchhiker  1.6490700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1726  hydroxyproline-2-epimerase  35.8 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.716077  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0853  proline racemase  35.16 
 
 		 331 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0901  proline racemase  35.16 
 
 		 331 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.699009  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1419  hydroxyproline-2-epimerase  36.23 
 
 		 332 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0468879  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3863  hydroxyproline-2-epimerase  34.41 
 
 		 333 aa  205  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.365358  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0802  proline racemase  34.58 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1703  hydroxyproline-2-epimerase  35.55 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129643  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1111  hydroxyproline-2-epimerase  35.38 
 
 		 337 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0943  putative proline racemase  34.29 
 
 		 334 aa  202  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0120446  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2065  hydroxyproline-2-epimerase  34.4 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.012514  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0460  Proline racemase  33.33 
 
 		 336 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0298  hydroxyproline-2-epimerase  35.55 
 
 		 332 aa  199  7.999999999999999e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.123258 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5694  proline racemase  31.5 
 
 		 335 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1478  4-hydroxyproline epimerase  35.29 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.857006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003673  4-hydroxyproline epimerase  37.54 
 
 		 301 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1660  proline racemase  32.08 
 
 		 335 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000137069  normal  0.0715412 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2339  proline racemase  34.94 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4859  hydroxyproline-2-epimerase  33.72 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5994  proline racemase  31.79 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3769  proline racemase  31.79 
 
 		 335 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00125754  normal  0.197113 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3344  proline racemase  31.79 
 
 		 335 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0227164 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3164  proline racemase  33.91 
 
 		 337 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4007  proline racemase  31.5 
 
 		 335 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4360  proline racemase  31.5 
 
 		 335 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4243  proline racemase  31.5 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000241278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1024  putative proline racemase  30.64 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0744753 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3519  putative proline racemase  33.62 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.235332  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4260  proline racemase  31.21 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4273  hydroxyproline-2-epimerase  34.2 
 
 		 333 aa  189  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2058  proline racemase  34.94 
 
 		 365 aa  188  9e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272833 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2141  proline racemase  33.72 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5572  hydroxyproline-2-epimerase  33.53 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000335762  normal  0.0993584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2251  proline racemase  30.81 
 
 		 335 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5265  hydroxyproline-2-epimerase  34.19 
 
 		 338 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3228  hydroxyproline-2-epimerase  34.66 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.771447 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1532  putative proline racemase  32.94 
 
 		 346 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5285  hydroxyproline-2-epimerase  30.81 
 
 		 332 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103378  normal  0.295156 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2361  proline racemase  30.88 
 
 		 346 aa  176  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000418015  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4841  hydroxyproline-2-epimerase  30.52 
 
 		 332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122801 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1763  proline racemase  30.57 
 
 		 346 aa  170  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000615926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3463  hydroxyproline-2-epimerase  33.12 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1450  hydroxyproline-2-epimerase  33.44 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1705  proline racemase  30.99 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.360365  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3467  hydroxyproline-2-epimerase  30.43 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2821  proline racemase  29.12 
 
 		 346 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1453  putative proline racemase  28.02 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.67245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>