138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2058 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2058  proline racemase  100 
 
 		 365 aa  742    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272833 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2339  proline racemase  51.01 
 
 		 361 aa  334  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2141  proline racemase  51.34 
 
 		 351 aa  328  7e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04640  proline racemase  50.15 
 
 		 343 aa  315  6e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1045  proline racemase  36.53 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3201  proline racemase  34.63 
 
 		 341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0659896  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3861  proline racemase  35.52 
 
 		 342 aa  190  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.438551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1529  proline racemase  34.63 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0477377  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0234  proline racemase  34.94 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5268  proline racemase  34.99 
 
 		 348 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3225  proline racemase  33.63 
 
 		 348 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.821364 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1184  proline racemase  34.23 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47970  hypothetical protein  33.13 
 
 		 344 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.301488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4137  hypothetical protein  33.24 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.583896  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2117  proline racemase  31.94 
 
 		 348 aa  172  7.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.231531 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2641  proline racemase  31.23 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0439  proline racemase  31.34 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0337  proline racemase, putative  30.15 
 
 		 342 aa  166  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0353  putative proline racemase  29.85 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.928096  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0518  hypothetical protein  30.95 
 
 		 347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4722  proline racemase  35.11 
 
 		 333 aa  162  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7022  hypothetical protein  31.83 
 
 		 342 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2885  putative proline racemase  32.38 
 
 		 345 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0107  proline racemase  31.42 
 
 		 345 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2846  putative proline racemase  32.06 
 
 		 345 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31580  proline racemase  34.15 
 
 		 333 aa  159  6e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2447  putative proline racemase  32.81 
 
 		 345 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0118  Proline racemase  31.12 
 
 		 345 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4845  proline racemase  32.13 
 
 		 344 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2643  proline racemase  31.95 
 
 		 345 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2834  proline racemase  31.95 
 
 		 345 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2637  proline racemase  32.27 
 
 		 345 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2594  proline racemase  31.63 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2840  putative proline racemase  31.63 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000647776 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2559  proline racemase  31.75 
 
 		 345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3503  Proline racemase  32.65 
 
 		 333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4111  Proline racemase  30.88 
 
 		 333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2259  proline racemase  31.91 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755409  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1587  proline racemase  30.54 
 
 		 338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0642  proline racemase  28.24 
 
 		 351 aa  146  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5915  proline racemase  31.99 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314959  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2863  proline racemase, putative  32.27 
 
 		 312 aa  143  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0431348  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3320  proline racemase  31.47 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6004  4-hydroxyproline epimerase  30.88 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.0460941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3463  hydroxyproline-2-epimerase  32 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1690  proline racemase  27.93 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4260  proline racemase  28.27 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5694  proline racemase  27.27 
 
 		 335 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1024  putative proline racemase  27.41 
 
 		 335 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0744753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1660  proline racemase  28.48 
 
 		 335 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000137069  normal  0.0715412 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5994  proline racemase  28.18 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4007  proline racemase  28.18 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4360  proline racemase  28.18 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4243  proline racemase  28.48 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000241278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3769  proline racemase  28.48 
 
 		 335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00125754  normal  0.197113 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1703  hydroxyproline-2-epimerase  28.92 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129643  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0460  Proline racemase  28.62 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3344  proline racemase  27.58 
 
 		 335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0227164 
 
 
-
 
NC_004310  BR1792  hydroxyproline-2-epimerase  29.28 
 
 		 333 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2251  proline racemase  28.92 
 
 		 335 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2363  hydroxyproline-2-epimerase  30.03 
 
 		 333 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00996894  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1726  hydroxyproline-2-epimerase  29.28 
 
 		 333 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.716077  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003673  4-hydroxyproline epimerase  27.96 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1530  hydroxyproline-2-epimerase  29.85 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1419  hydroxyproline-2-epimerase  29.13 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0468879  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2361  proline racemase  25.6 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000418015  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1453  putative proline racemase  24.04 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.67245  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1763  proline racemase  26.63 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000615926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0989  putative proline racemase  25.53 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0492400000000001e-61 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1111  hydroxyproline-2-epimerase  28.95 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920734  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1705  proline racemase  24.63 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.360365  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1761  hydroxyproline-2-epimerase  27.71 
 
 		 333 aa  109  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000415144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4388  putative proline racemase  24.32 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.208598  hitchhiker  1.6490700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0994  proline racemase, putative  24.92 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0799  proline racemase  24.01 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0802  proline racemase  24.92 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1082  putative proline racemase  24.92 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0943  putative proline racemase  24.01 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0120446  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4273  hydroxyproline-2-epimerase  27.91 
 
 		 333 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4841  hydroxyproline-2-epimerase  26.36 
 
 		 332 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122801 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3863  hydroxyproline-2-epimerase  27.3 
 
 		 333 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.365358  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1450  hydroxyproline-2-epimerase  28.19 
 
 		 305 aa  106  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1478  4-hydroxyproline epimerase  27.46 
 
 		 334 aa  106  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.857006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1532  putative proline racemase  27.12 
 
 		 346 aa  106  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2065  hydroxyproline-2-epimerase  30.03 
 
 		 333 aa  106  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.012514  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0498  proline racemase  27.96 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0853  proline racemase  24.92 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0901  proline racemase  24.92 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.699009  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2823  hydroxyproline-2-epimerase  25.53 
 
 		 333 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  normal  0.582579 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5285  hydroxyproline-2-epimerase  26.06 
 
 		 332 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103378  normal  0.295156 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2821  proline racemase  26.61 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5997  Proline racemase  31.49 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.720935  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3519  putative proline racemase  27.3 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.235332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0800  proline racemase  23.4 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4859  hydroxyproline-2-epimerase  28.29 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3164  proline racemase  26.9 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3837  proline racemase  29.8 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5572  hydroxyproline-2-epimerase  26.51 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000335762  normal  0.0993584 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3467  hydroxyproline-2-epimerase  27.98 
 
 		 333 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1219  proline racemase  26.56 
 
 		 332 aa  99.4  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>