150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2065 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2065  hydroxyproline-2-epimerase  100 
 
 		 333 aa  682    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.012514  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1792  hydroxyproline-2-epimerase  65.15 
 
 		 333 aa  471  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1726  hydroxyproline-2-epimerase  65.15 
 
 		 333 aa  471  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.716077  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3863  hydroxyproline-2-epimerase  64.46 
 
 		 333 aa  467  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.365358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1111  hydroxyproline-2-epimerase  65.27 
 
 		 337 aa  464  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920734  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1419  hydroxyproline-2-epimerase  67.58 
 
 		 332 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0468879  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0498  proline racemase  64.85 
 
 		 333 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4859  hydroxyproline-2-epimerase  60.66 
 
 		 334 aa  431  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0298  hydroxyproline-2-epimerase  60.91 
 
 		 332 aa  428  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.123258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4273  hydroxyproline-2-epimerase  60.79 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1478  4-hydroxyproline epimerase  58.31 
 
 		 334 aa  417  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.857006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5572  hydroxyproline-2-epimerase  56.23 
 
 		 333 aa  395  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000335762  normal  0.0993584 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1761  hydroxyproline-2-epimerase  55.15 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000415144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2823  hydroxyproline-2-epimerase  56.06 
 
 		 333 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  normal  0.582579 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1530  hydroxyproline-2-epimerase  56.67 
 
 		 333 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3463  hydroxyproline-2-epimerase  60.71 
 
 		 308 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3467  hydroxyproline-2-epimerase  56.5 
 
 		 333 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2363  hydroxyproline-2-epimerase  55.45 
 
 		 333 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00996894  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1703  hydroxyproline-2-epimerase  53.94 
 
 		 333 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129643  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5285  hydroxyproline-2-epimerase  54.55 
 
 		 332 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103378  normal  0.295156 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4841  hydroxyproline-2-epimerase  53.64 
 
 		 332 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122801 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003673  4-hydroxyproline epimerase  57.38 
 
 		 301 aa  359  3e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7251  hydroxyproline-2-epimerase  53.64 
 
 		 332 aa  353  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3228  hydroxyproline-2-epimerase  48.35 
 
 		 338 aa  328  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.771447 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5265  hydroxyproline-2-epimerase  48.35 
 
 		 338 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994352  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1450  hydroxyproline-2-epimerase  50.99 
 
 		 305 aa  322  4e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6004  4-hydroxyproline epimerase  48.64 
 
 		 333 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.0460941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3503  Proline racemase  47.43 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2559  proline racemase  44.91 
 
 		 345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5915  proline racemase  45.92 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314959  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2594  proline racemase  44.91 
 
 		 345 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2846  putative proline racemase  44.58 
 
 		 345 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2259  proline racemase  44.01 
 
 		 337 aa  282  5.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755409  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2643  proline racemase  44.91 
 
 		 345 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2834  proline racemase  44.91 
 
 		 345 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2840  putative proline racemase  44.91 
 
 		 345 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000647776 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2885  putative proline racemase  44.61 
 
 		 345 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2447  putative proline racemase  44.58 
 
 		 345 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2637  proline racemase  44.71 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4722  proline racemase  46.85 
 
 		 333 aa  276  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4111  Proline racemase  45.18 
 
 		 333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31580  proline racemase  45.15 
 
 		 333 aa  263  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2863  proline racemase, putative  44.19 
 
 		 312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0431348  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0943  putative proline racemase  36.89 
 
 		 334 aa  242  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0120446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0989  putative proline racemase  35.67 
 
 		 331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0492400000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4388  putative proline racemase  36.28 
 
 		 334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.208598  hitchhiker  1.6490700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1082  putative proline racemase  36.78 
 
 		 334 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0460  Proline racemase  39.46 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0802  proline racemase  35.37 
 
 		 331 aa  237  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1690  proline racemase  40.36 
 
 		 335 aa  236  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0853  proline racemase  35.37 
 
 		 331 aa  235  8e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0901  proline racemase  35.37 
 
 		 331 aa  235  8e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.699009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0994  proline racemase, putative  35.87 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0799  proline racemase  36.75 
 
 		 334 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1660  proline racemase  37.99 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000137069  normal  0.0715412 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5994  proline racemase  37.99 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4007  proline racemase  37.99 
 
 		 335 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4360  proline racemase  37.99 
 
 		 335 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0800  proline racemase  34.95 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2251  proline racemase  37.24 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3769  proline racemase  37.39 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00125754  normal  0.197113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0642  proline racemase  40.48 
 
 		 351 aa  227  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4243  proline racemase  37.39 
 
 		 335 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000241278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4260  proline racemase  37.69 
 
 		 335 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5694  proline racemase  37.39 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1024  putative proline racemase  37.08 
 
 		 335 aa  222  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0744753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3344  proline racemase  35.47 
 
 		 335 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0227164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0234  proline racemase  34.4 
 
 		 350 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1045  proline racemase  34.43 
 
 		 340 aa  199  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4226  hydroxyproline-2-epimerase  38.51 
 
 		 359 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068092  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4140  hydroxyproline-2-epimerase  38.51 
 
 		 359 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.465204  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3379  hydroxyproline-2-epimerase  38.2 
 
 		 310 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3519  putative proline racemase  32.73 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.235332  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1894  hydroxyproline-2-epimerase  38.2 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321718 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0874  putative proline racemase  39.94 
 
 		 318 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4560  proline racemase  39.63 
 
 		 341 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3966  proline racemase  38.3 
 
 		 323 aa  189  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4667  proline racemase  37 
 
 		 344 aa  189  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  0.66467 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1453  putative proline racemase  32.22 
 
 		 355 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.67245  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3164  proline racemase  32.43 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4447  hydroxyproline-2-epimerase  37.77 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3550  hydroxyproline-2-epimerase  37.46 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4845  proline racemase  33.03 
 
 		 344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4031  hydroxyproline-2-epimerase  36.84 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2308  proline racemase  37.58 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.346868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2499  proline racemase  35.69 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.293711  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5268  proline racemase  33.53 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4133  proline racemase  36.65 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2705  proline racemase  35.56 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1258  proline racemase  35.71 
 
 		 308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.687008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1285  proline racemase  36.65 
 
 		 308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.753668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3837  proline racemase  35.73 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47840  hypothetical protein  37.05 
 
 		 314 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000281004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1532  putative proline racemase  32.63 
 
 		 346 aa  179  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2713  4-hydroxyproline epimerase  31.32 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3225  proline racemase  32.02 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.821364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4122  hypothetical protein  37.61 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0159506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47970  hypothetical protein  34.64 
 
 		 344 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.301488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1219  proline racemase  32.54 
 
 		 332 aa  176  5e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2361  proline racemase  33.24 
 
 		 346 aa  176  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000418015  normal  0.500055 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>