140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3320 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3320  proline racemase  100 
 
 		 336 aa  692    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4845  proline racemase  46.73 
 
 		 344 aa  305  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5268  proline racemase  44.67 
 
 		 348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3225  proline racemase  43.71 
 
 		 348 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.821364 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0118  Proline racemase  43.62 
 
 		 345 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0107  proline racemase  43.62 
 
 		 345 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0518  hypothetical protein  43.36 
 
 		 347 aa  260  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0439  proline racemase  41.07 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0337  proline racemase, putative  41 
 
 		 342 aa  246  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1184  proline racemase  41.37 
 
 		 342 aa  246  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0353  putative proline racemase  40.71 
 
 		 342 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.928096  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1045  proline racemase  40.3 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7022  hypothetical protein  42.86 
 
 		 342 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283298  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3861  proline racemase  41.12 
 
 		 342 aa  235  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.438551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1587  proline racemase  40.42 
 
 		 338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2641  proline racemase  38.69 
 
 		 342 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1529  proline racemase  39.64 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0477377  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4137  hypothetical protein  40.18 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.583896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47970  hypothetical protein  40.88 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.301488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2117  proline racemase  37.98 
 
 		 348 aa  222  9e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.231531 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0234  proline racemase  35.16 
 
 		 350 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3201  proline racemase  38.51 
 
 		 341 aa  219  6e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0659896  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2259  proline racemase  34.06 
 
 		 337 aa  208  8e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6004  4-hydroxyproline epimerase  33.33 
 
 		 333 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.0460941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4111  Proline racemase  33.33 
 
 		 333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5915  proline racemase  33.44 
 
 		 333 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314959  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31580  proline racemase  33.54 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1690  proline racemase  34.44 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3503  Proline racemase  33.13 
 
 		 333 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4722  proline racemase  34.26 
 
 		 333 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2594  proline racemase  31.79 
 
 		 345 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2559  proline racemase  31.58 
 
 		 345 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2840  putative proline racemase  31.79 
 
 		 345 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000647776 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2643  proline racemase  31.48 
 
 		 345 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2834  proline racemase  31.48 
 
 		 345 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2885  putative proline racemase  31.58 
 
 		 345 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2447  putative proline racemase  31.17 
 
 		 345 aa  165  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1761  hydroxyproline-2-epimerase  33.75 
 
 		 333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000415144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2637  proline racemase  30.56 
 
 		 345 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2846  putative proline racemase  30.25 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2361  proline racemase  29.41 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000418015  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5694  proline racemase  29.27 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0642  proline racemase  32.62 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4243  proline racemase  30.06 
 
 		 335 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000241278  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1453  putative proline racemase  29.32 
 
 		 355 aa  156  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.67245  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1660  proline racemase  30.06 
 
 		 335 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000137069  normal  0.0715412 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1024  putative proline racemase  28.57 
 
 		 335 aa  155  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0744753 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1703  hydroxyproline-2-epimerase  30.25 
 
 		 333 aa  155  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129643  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3769  proline racemase  29.45 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00125754  normal  0.197113 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4260  proline racemase  29.54 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2823  hydroxyproline-2-epimerase  32.2 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  normal  0.582579 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3344  proline racemase  29.39 
 
 		 335 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0227164 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2251  proline racemase  29.18 
 
 		 335 aa  152  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1530  hydroxyproline-2-epimerase  30.86 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5994  proline racemase  29.14 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2863  proline racemase, putative  29.8 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0431348  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4007  proline racemase  29.14 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4360  proline racemase  29.14 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2141  proline racemase  30.56 
 
 		 351 aa  149  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003673  4-hydroxyproline epimerase  28.67 
 
 		 301 aa  149  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1532  putative proline racemase  29.63 
 
 		 346 aa  149  9e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2363  hydroxyproline-2-epimerase  30.65 
 
 		 333 aa  149  9e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00996894  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2339  proline racemase  29.63 
 
 		 361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3228  hydroxyproline-2-epimerase  32.01 
 
 		 338 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.771447 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2065  hydroxyproline-2-epimerase  30.96 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.012514  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1419  hydroxyproline-2-epimerase  29.94 
 
 		 332 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0468879  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0853  proline racemase  27.64 
 
 		 331 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0901  proline racemase  27.64 
 
 		 331 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.699009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0994  proline racemase, putative  27.95 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2058  proline racemase  31.47 
 
 		 365 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272833 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1450  hydroxyproline-2-epimerase  30.59 
 
 		 305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1705  proline racemase  27.78 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.360365  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5265  hydroxyproline-2-epimerase  30.28 
 
 		 338 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2821  proline racemase  27.16 
 
 		 346 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0802  proline racemase  27.95 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1082  putative proline racemase  27.61 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1763  proline racemase  27.69 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000615926  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0799  proline racemase  27.3 
 
 		 334 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0989  putative proline racemase  27.61 
 
 		 331 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0492400000000001e-61 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5997  Proline racemase  30.41 
 
 		 336 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.720935  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_004310  BR1792  hydroxyproline-2-epimerase  29.23 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0943  putative proline racemase  27.3 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0120446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4388  putative proline racemase  27.3 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.208598  hitchhiker  1.6490700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1726  hydroxyproline-2-epimerase  29.23 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.716077  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5285  hydroxyproline-2-epimerase  29.28 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103378  normal  0.295156 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0800  proline racemase  26.71 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0460  Proline racemase  26.89 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3463  hydroxyproline-2-epimerase  33.22 
 
 		 308 aa  133  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1111  hydroxyproline-2-epimerase  27.44 
 
 		 337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920734  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0298  hydroxyproline-2-epimerase  30.15 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.123258 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3467  hydroxyproline-2-epimerase  29.66 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3863  hydroxyproline-2-epimerase  28.79 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.365358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04640  proline racemase  29.54 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4841  hydroxyproline-2-epimerase  28.66 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122801 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0498  proline racemase  30.98 
 
 		 333 aa  129  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3519  putative proline racemase  27.03 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.235332  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4859  hydroxyproline-2-epimerase  29.54 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3164  proline racemase  27.03 
 
 		 337 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2308  proline racemase  32.01 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.346868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1478  4-hydroxyproline epimerase  29.1 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.857006  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>