150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04640 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_04640  proline racemase  100 
 
 		 343 aa  678    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2339  proline racemase  52.92 
 
 		 361 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2141  proline racemase  51.75 
 
 		 351 aa  349  4e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2058  proline racemase  50.15 
 
 		 365 aa  315  5e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272833 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1529  proline racemase  38.07 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0477377  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0234  proline racemase  36.73 
 
 		 350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1045  proline racemase  36.53 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5268  proline racemase  36.56 
 
 		 348 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3861  proline racemase  36.67 
 
 		 342 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.438551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3201  proline racemase  35.15 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0659896  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3225  proline racemase  35.65 
 
 		 348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.821364 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7022  hypothetical protein  33.64 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283298  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2641  proline racemase  32.63 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1184  proline racemase  33.23 
 
 		 342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4137  hypothetical protein  35.76 
 
 		 344 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.583896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47970  hypothetical protein  35.15 
 
 		 344 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.301488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0439  proline racemase  33.13 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1587  proline racemase  32.53 
 
 		 338 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0118  Proline racemase  33.43 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2447  putative proline racemase  33.84 
 
 		 345 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0642  proline racemase  33.94 
 
 		 351 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_004310  BR0337  proline racemase, putative  32.53 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2559  proline racemase  33.23 
 
 		 345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2117  proline racemase  30.91 
 
 		 348 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.231531 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2885  putative proline racemase  32.93 
 
 		 345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0107  proline racemase  33.13 
 
 		 345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0353  putative proline racemase  32.23 
 
 		 342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.928096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2846  putative proline racemase  33.53 
 
 		 345 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4845  proline racemase  34.34 
 
 		 344 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2637  proline racemase  33.53 
 
 		 345 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2594  proline racemase  32.63 
 
 		 345 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2840  putative proline racemase  32.63 
 
 		 345 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000647776 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2643  proline racemase  32.34 
 
 		 345 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2834  proline racemase  32.34 
 
 		 345 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31580  proline racemase  34.24 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2259  proline racemase  33.03 
 
 		 337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3503  Proline racemase  32.33 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4722  proline racemase  34.43 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5915  proline racemase  32.02 
 
 		 333 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314959  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0518  hypothetical protein  31.23 
 
 		 347 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4111  Proline racemase  30.21 
 
 		 333 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650339  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2863  proline racemase, putative  33.11 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0431348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6004  4-hydroxyproline epimerase  33.33 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.0460941 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2823  hydroxyproline-2-epimerase  31.72 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  normal  0.582579 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2363  hydroxyproline-2-epimerase  30.77 
 
 		 333 aa  137  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00996894  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5694  proline racemase  28.14 
 
 		 335 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4260  proline racemase  29.04 
 
 		 335 aa  135  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1792  hydroxyproline-2-epimerase  29.57 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1690  proline racemase  29.85 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2251  proline racemase  29.75 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1726  hydroxyproline-2-epimerase  29.57 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.716077  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5572  hydroxyproline-2-epimerase  30.36 
 
 		 333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000335762  normal  0.0993584 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4007  proline racemase  29.34 
 
 		 335 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4360  proline racemase  29.34 
 
 		 335 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1478  4-hydroxyproline epimerase  31.75 
 
 		 334 aa  132  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.857006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1894  hydroxyproline-2-epimerase  32.32 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321718 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1419  hydroxyproline-2-epimerase  30.49 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0468879  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4273  hydroxyproline-2-epimerase  30 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3320  proline racemase  29.54 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5994  proline racemase  29.04 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1024  putative proline racemase  27.54 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0744753 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3379  hydroxyproline-2-epimerase  32.32 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1453  putative proline racemase  25.77 
 
 		 355 aa  130  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.67245  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3769  proline racemase  28.96 
 
 		 335 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00125754  normal  0.197113 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4243  proline racemase  28.96 
 
 		 335 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000241278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1660  proline racemase  28.66 
 
 		 335 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000137069  normal  0.0715412 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1703  hydroxyproline-2-epimerase  30.15 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129643  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4226  hydroxyproline-2-epimerase  32.32 
 
 		 359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068092  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4140  hydroxyproline-2-epimerase  32.32 
 
 		 359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.465204  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1530  hydroxyproline-2-epimerase  29.85 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0989  putative proline racemase  27.41 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0492400000000001e-61 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1111  hydroxyproline-2-epimerase  29.22 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0943  putative proline racemase  26.81 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0120446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0994  proline racemase, putative  26.73 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4388  putative proline racemase  26.81 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.208598  hitchhiker  1.6490700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2065  hydroxyproline-2-epimerase  30.63 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.012514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0800  proline racemase  26.27 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1082  putative proline racemase  26.2 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3550  hydroxyproline-2-epimerase  31.5 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1532  putative proline racemase  29.45 
 
 		 346 aa  122  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0498  proline racemase  30.49 
 
 		 333 aa  122  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4031  hydroxyproline-2-epimerase  31.5 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3467  hydroxyproline-2-epimerase  29.64 
 
 		 333 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3164  proline racemase  28.61 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1761  hydroxyproline-2-epimerase  29.23 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000415144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4447  hydroxyproline-2-epimerase  31.4 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0799  proline racemase  26.51 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0802  proline racemase  26.81 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3344  proline racemase  26.65 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0227164 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3519  putative proline racemase  28.32 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.235332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0853  proline racemase  26.28 
 
 		 331 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0901  proline racemase  26.28 
 
 		 331 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.699009  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0460  Proline racemase  26.83 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1840  proline racemase  31.52 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1705  proline racemase  26.69 
 
 		 346 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.360365  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1450  hydroxyproline-2-epimerase  29.43 
 
 		 305 aa  117  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2361  proline racemase  29.03 
 
 		 346 aa  116  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000418015  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3863  hydroxyproline-2-epimerase  28.74 
 
 		 333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.365358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0874  putative proline racemase  30.84 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4841  hydroxyproline-2-epimerase  29.73 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122801 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>