150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2317 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2317  Proline racemase  100 
 
 		 338 aa  667    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5997  Proline racemase  58.21 
 
 		 336 aa  352  5.9999999999999994e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.720935  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2251  proline racemase  51.63 
 
 		 335 aa  306  3e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0642  proline racemase  44.48 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4388  putative proline racemase  41.82 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.208598  hitchhiker  1.6490700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1082  putative proline racemase  42.3 
 
 		 334 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0799  proline racemase  41.99 
 
 		 334 aa  243  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0853  proline racemase  41.82 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0802  proline racemase  41.21 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0901  proline racemase  41.82 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.699009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0994  proline racemase, putative  41.69 
 
 		 334 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0800  proline racemase  41.87 
 
 		 334 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0943  putative proline racemase  41.99 
 
 		 334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0120446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0989  putative proline racemase  41.21 
 
 		 331 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0492400000000001e-61 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2361  proline racemase  42.81 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000418015  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1453  putative proline racemase  41.25 
 
 		 355 aa  229  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.67245  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1763  proline racemase  40.96 
 
 		 346 aa  229  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000615926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2821  proline racemase  42.34 
 
 		 346 aa  225  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1532  putative proline racemase  40.42 
 
 		 346 aa  223  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3344  proline racemase  42.31 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0227164 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1024  putative proline racemase  41.49 
 
 		 335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0744753 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4260  proline racemase  42.99 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1660  proline racemase  42.69 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000137069  normal  0.0715412 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5994  proline racemase  42.69 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5694  proline racemase  40.9 
 
 		 335 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4007  proline racemase  42.69 
 
 		 335 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4360  proline racemase  42.69 
 
 		 335 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4243  proline racemase  42.69 
 
 		 335 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000241278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3769  proline racemase  42.69 
 
 		 335 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00125754  normal  0.197113 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2259  proline racemase  38.95 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755409  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1705  proline racemase  37.91 
 
 		 346 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.360365  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0460  Proline racemase  37.79 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4111  Proline racemase  38.81 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6004  4-hydroxyproline epimerase  38.55 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.0460941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3503  Proline racemase  39.34 
 
 		 333 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2643  proline racemase  32.34 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2840  putative proline racemase  32.63 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000647776 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2834  proline racemase  32.34 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2559  proline racemase  32.34 
 
 		 345 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3863  hydroxyproline-2-epimerase  34.22 
 
 		 333 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.365358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2885  putative proline racemase  32.84 
 
 		 345 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2823  hydroxyproline-2-epimerase  33.83 
 
 		 333 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  normal  0.582579 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2594  proline racemase  32.34 
 
 		 345 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1792  hydroxyproline-2-epimerase  35.14 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0498  proline racemase  36.14 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2846  putative proline racemase  33.13 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1726  hydroxyproline-2-epimerase  35.14 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.716077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2447  putative proline racemase  33.63 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1045  proline racemase  34.94 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2637  proline racemase  33.33 
 
 		 345 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4859  hydroxyproline-2-epimerase  35.33 
 
 		 334 aa  179  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31580  proline racemase  38.25 
 
 		 333 aa  179  8e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5265  hydroxyproline-2-epimerase  36.34 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5915  proline racemase  36.25 
 
 		 333 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314959  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4273  hydroxyproline-2-epimerase  33.93 
 
 		 333 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2065  hydroxyproline-2-epimerase  34.93 
 
 		 333 aa  175  8e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.012514  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2363  hydroxyproline-2-epimerase  32.94 
 
 		 333 aa  175  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00996894  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1478  4-hydroxyproline epimerase  33.94 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.857006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1690  proline racemase  37.76 
 
 		 335 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1111  hydroxyproline-2-epimerase  34.51 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920734  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5572  hydroxyproline-2-epimerase  33.43 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000335762  normal  0.0993584 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3228  hydroxyproline-2-epimerase  35.74 
 
 		 338 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.771447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4722  proline racemase  36.67 
 
 		 333 aa  172  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0298  hydroxyproline-2-epimerase  34.65 
 
 		 332 aa  172  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.123258 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1530  hydroxyproline-2-epimerase  32.84 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1703  hydroxyproline-2-epimerase  32.25 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129643  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003673  4-hydroxyproline epimerase  32.25 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1761  hydroxyproline-2-epimerase  32.06 
 
 		 333 aa  170  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000415144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1419  hydroxyproline-2-epimerase  33.43 
 
 		 332 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0468879  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2863  proline racemase, putative  31.6 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0431348  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5268  proline racemase  35.63 
 
 		 348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3463  hydroxyproline-2-epimerase  37.85 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5285  hydroxyproline-2-epimerase  33.63 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103378  normal  0.295156 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3467  hydroxyproline-2-epimerase  33.94 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3225  proline racemase  34.13 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.821364 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3519  putative proline racemase  31.61 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.235332  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4841  hydroxyproline-2-epimerase  32.45 
 
 		 332 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122801 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0518  hypothetical protein  34.04 
 
 		 347 aa  155  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3164  proline racemase  31.31 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0234  proline racemase  30.29 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7251  hydroxyproline-2-epimerase  33.33 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1450  hydroxyproline-2-epimerase  30.57 
 
 		 305 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0118  Proline racemase  30.84 
 
 		 345 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0107  proline racemase  31.14 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4845  proline racemase  33.23 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3837  proline racemase  33.53 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4137  hypothetical protein  30.33 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.583896  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3966  proline racemase  34.34 
 
 		 323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47970  hypothetical protein  29.73 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.301488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3201  proline racemase  28.14 
 
 		 341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0659896  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1044  proline racemase  33.33 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2641  proline racemase  28.23 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1840  proline racemase  31.21 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1184  proline racemase  28.57 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4133  proline racemase  33.73 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2308  proline racemase  34.05 
 
 		 308 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.346868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1258  proline racemase  34.43 
 
 		 308 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.687008 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3861  proline racemase  29.46 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.438551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1529  proline racemase  28.4 
 
 		 346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0477377  normal  0.266865 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02121  proline racemase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02000)  34.57 
 
 		 401 aa  126  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0070174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>