22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0308 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0308  flavoprotein  100 
 
 		 125 aa  263  7e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21882  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  74.4 
 
 		 219 aa  206  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004454  putative reductase  66.4 
 
 		 188 aa  179  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.418649  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00942  hypothetical protein  66.4 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2714  NADPH-dependent FMN reductase  66.4 
 
 		 223 aa  167  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37671  predicted protein  48.04 
 
 		 289 aa  94.7  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  40.2 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  38.32 
 
 		 192 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  38.18 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  37.27 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  34.55 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  36.79 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  35.19 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  36.11 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4290  putative NADPH-dependent FMN reductase  36.27 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618553 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  32.11 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1339  NADPH-dependent FMN reductase  34.74 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  37.35 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  30.91 
 
 		 192 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  34.12 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  32.93 
 
 		 194 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  26.67 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>