More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1493 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
194 aa  397  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  56.25 
 
 
193 aa  223  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  53.12 
 
 
190 aa  211  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  52.36 
 
 
227 aa  205  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  54.17 
 
 
186 aa  202  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  53.81 
 
 
197 aa  197  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  51.87 
 
 
189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  48.48 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  52.36 
 
 
189 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  50.54 
 
 
214 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  49.23 
 
 
197 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  47.62 
 
 
202 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  48.99 
 
 
205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  45.74 
 
 
194 aa  169  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  51.85 
 
 
205 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  45.21 
 
 
192 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  41.27 
 
 
198 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  44.04 
 
 
188 aa  154  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  38.42 
 
 
203 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
178 aa  142  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  41.49 
 
 
187 aa  136  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  39.89 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  37.37 
 
 
188 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  39.25 
 
 
186 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  40.86 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  39.46 
 
 
197 aa  115  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  37.04 
 
 
191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  36.92 
 
 
199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  33.86 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  36.76 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  38.35 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  34.62 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  34.76 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  31.89 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3505  NADPH-dependent FMN reductase  42.53 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.647475  normal  0.990835 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  30.94 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  35.5 
 
 
197 aa  108  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  35.75 
 
 
192 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  32.31 
 
 
372 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  39.33 
 
 
183 aa  106  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  37.84 
 
 
192 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  39.46 
 
 
192 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  34.39 
 
 
183 aa  101  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  35.68 
 
 
197 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 
192 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  34.78 
 
 
350 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  35.23 
 
 
201 aa  98.6  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4166  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 
190 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  37.06 
 
 
190 aa  95.5  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  29.89 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 
196 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3838  NADPH-dependent FMN reductase  37.23 
 
 
190 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  34.41 
 
 
196 aa  92  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  40.68 
 
 
178 aa  91.7  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4165  NADPH-dependent FMN reductase  44.55 
 
 
113 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174255  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  31.96 
 
 
306 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  31.79 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3024  NADPH-dependent FMN reductase  32.45 
 
 
186 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1339  NADPH-dependent FMN reductase  33.88 
 
 
196 aa  85.9  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  30.48 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  30.48 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  29.95 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  32 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  29.95 
 
 
192 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  35.86 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  33.95 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  37.78 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  37.78 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  37.78 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  37.78 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  37.78 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  37.78 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  37.78 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  34.67 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  31.55 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  37.06 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  31.55 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  37.78 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17270  predicted flavoprotein  33.96 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.74 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4580  NADPH-dependent FMN reductase  32.8 
 
 
303 aa  71.2  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  31.55 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  32.02 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5059  NADPH-dependent FMN reductase  35.59 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  30.73 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  38.06 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  29.53 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4290  putative NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618553 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  29.53 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  36.3 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004454  putative reductase  28 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.418649  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37671  predicted protein  25.94 
 
 
289 aa  67  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  30.72 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4056  NADPH-dependent FMN reductase  30.94 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  36.17 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  36.17 
 
 
194 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>