250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2352 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
372 aa  747    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  80.35 
 
 
350 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  46.45 
 
 
190 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  44.68 
 
 
192 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  45.05 
 
 
188 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  41.88 
 
 
195 aa  155  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  41.27 
 
 
188 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  45.55 
 
 
190 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  42.02 
 
 
188 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  40.86 
 
 
190 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  35.11 
 
 
187 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  39.9 
 
 
197 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  39.15 
 
 
187 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  38.74 
 
 
183 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3780  GCN5-related N-acetyltransferase  46.27 
 
 
159 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  35.29 
 
 
209 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  34.38 
 
 
190 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  42.78 
 
 
189 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  37.91 
 
 
186 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  37.63 
 
 
192 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
178 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  36.51 
 
 
191 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  35.38 
 
 
214 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  32.31 
 
 
194 aa  107  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5059  NADPH-dependent FMN reductase  46.85 
 
 
188 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  35.15 
 
 
201 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  39.1 
 
 
193 aa  99.8  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  34.54 
 
 
192 aa  99.8  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3256  tRNA (Guanine37-N1) methyltransferase  42.11 
 
 
385 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.840049  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  34.36 
 
 
199 aa  97.4  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  32.02 
 
 
183 aa  96.3  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  30.92 
 
 
190 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  32.66 
 
 
189 aa  95.5  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  35.42 
 
 
227 aa  95.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
205 aa  90.5  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  34.81 
 
 
194 aa  89.7  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  32.29 
 
 
186 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  37.75 
 
 
202 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  30.37 
 
 
188 aa  86.7  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  34.69 
 
 
192 aa  86.3  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  31.38 
 
 
187 aa  85.9  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  34.9 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
197 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  33.16 
 
 
197 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  31.61 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  30.22 
 
 
198 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  28.5 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  31.31 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  32.86 
 
 
178 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  41.18 
 
 
203 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  29.23 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03840  conserved hypothetical protein  29.35 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  36.52 
 
 
192 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17270  predicted flavoprotein  34.75 
 
 
180 aa  71.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1732  GCN5-related N-acetyltransferase  34.92 
 
 
154 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1547  GCN5-related N-acetyltransferase  37.3 
 
 
164 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.560238 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4387  GCN5-related N-acetyltransferase  35.34 
 
 
153 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4165  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 
113 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174255  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1491  GCN5-related N-acetyltransferase  36.51 
 
 
160 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.51524  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2507  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 
166 aa  67  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1522  GCN5-related N-acetyltransferase  30.47 
 
 
156 aa  67  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2848  GCN5-related N-acetyltransferase  37.01 
 
 
161 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108205  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0962  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
172 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3505  NADPH-dependent FMN reductase  33.58 
 
 
188 aa  65.1  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.647475  normal  0.990835 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0083  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
160 aa  63.9  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  34.27 
 
 
205 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  27.92 
 
 
306 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2992  GCN5-related protein N-acetyltransferase  33.88 
 
 
179 aa  62.8  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  29.93 
 
 
192 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  28.86 
 
 
196 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1478  GCN5-related N-acetyltransferase  38.06 
 
 
158 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.147785  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1201  GCN5-related N-acetyltransferase  37.59 
 
 
164 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0749  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
179 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.743361  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4580  NADPH-dependent FMN reductase  28.43 
 
 
303 aa  60.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2969  GCN5-related N-acetyltransferase  35.88 
 
 
155 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  29.25 
 
 
192 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  28.37 
 
 
183 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  31.07 
 
 
188 aa  59.7  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3279  NADPH-dependent FMN reductase  30.35 
 
 
204 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.097942 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1243  GCN5-related N-acetyltransferase  22.7 
 
 
153 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1079  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 
204 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  30.61 
 
 
184 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28000  acetyltransferase (GNAT) family protein  29.77 
 
 
175 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0943003  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0691  GCN5-related N-acetyltransferase  30.58 
 
 
160 aa  58.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
192 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1010  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 
204 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  29.49 
 
 
183 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3177  NADPH-dependent FMN reductase  29.95 
 
 
204 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1017  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 
204 aa  57  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390057  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2999  NADPH-dependent FMN reductase  30.46 
 
 
204 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00930809  normal  0.251382 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3080  NADPH-dependent FMN reductase  30.46 
 
 
204 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0693742  normal  0.504641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4290  putative NADPH-dependent FMN reductase  28.48 
 
 
196 aa  56.6  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 
192 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1112  NADPH-dependent FMN reductase  29.85 
 
 
204 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 
192 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  31.54 
 
 
188 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  31.54 
 
 
194 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3798  NADPH-dependent FMN reductase  36.99 
 
 
202 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000652253 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  32.2 
 
 
183 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  31.54 
 
 
188 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>