73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2999 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3080  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
204 aa  427  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0693742  normal  0.504641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2999  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
204 aa  427  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00930809  normal  0.251382 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3177  NADPH-dependent FMN reductase  97.06 
 
 
204 aa  418  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3585  azoreductase, putative  91.18 
 
 
204 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1112  NADPH-dependent FMN reductase  85.78 
 
 
204 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795059 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1079  NADPH-dependent FMN reductase  84.8 
 
 
204 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1010  NADPH-dependent FMN reductase  84.8 
 
 
204 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3279  NADPH-dependent FMN reductase  84.31 
 
 
204 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.097942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1017  NADPH-dependent FMN reductase  82.84 
 
 
204 aa  364  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390057  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1047  NADPH-dependent FMN reductase  62.5 
 
 
210 aa  271  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.418607  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0887  NADPH-dependent FMN reductase  62.98 
 
 
202 aa  270  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0994  NADPH-dependent FMN reductase  59.82 
 
 
218 aa  269  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0914  NADPH-dependent FMN reductase  63.29 
 
 
201 aa  265  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0090  hypothetical protein  50 
 
 
210 aa  207  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2787  azoreductase, putative  45.03 
 
 
194 aa  154  8e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0985  NADPH-dependent FMN reductase  37.91 
 
 
202 aa  138  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1997  NADPH-dependent FMN reductase  42.25 
 
 
198 aa  132  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.88361  normal  0.0341206 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0067  putative oxidoreductase  34.13 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1668  azobenzene reductase  32.86 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2096  azobenzene reductase  36.36 
 
 
178 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284733  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2276  azoreductase  35.54 
 
 
178 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.39855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2122  azoreductase  35.54 
 
 
178 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.120348  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3066  azoreductase  35.54 
 
 
178 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2386  azoreductase  35.54 
 
 
178 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2259  azoreductase  35.54 
 
 
178 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  30.73 
 
 
188 aa  58.5  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  33.9 
 
 
178 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  33.9 
 
 
178 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2302  azoreductase  34.71 
 
 
178 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00698178 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2310  azoreductase  32.23 
 
 
179 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.702721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2060  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  34.71 
 
 
178 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2056  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  34.71 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  30.46 
 
 
372 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0533  NADPH-dependent FMN reductase  28.39 
 
 
176 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1954  NADPH-dependent FMN reductase  27.97 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.867559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  29.61 
 
 
188 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  27.6 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
182 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  29.8 
 
 
192 aa  48.9  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  28.27 
 
 
350 aa  48.5  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  27.74 
 
 
188 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0597  hypothetical protein  28.46 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0583  hypothetical protein  28.46 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.600123  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  26 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  22.68 
 
 
190 aa  47  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  28 
 
 
195 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5221  NADPH-dependent FMN reductase  27.1 
 
 
181 aa  46.6  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.681461  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  28.23 
 
 
186 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 
195 aa  45.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  28.3 
 
 
190 aa  46.2  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  27.71 
 
 
192 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3750  NADPH-dependent FMN reductase  27.59 
 
 
199 aa  45.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1148  NADPH-dependent FMN reductase  28.32 
 
 
183 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148322  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  27.55 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1726  NADPH-dependent FMN reductase  31.97 
 
 
280 aa  44.7  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  28.46 
 
 
188 aa  44.7  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  30.4 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  24.32 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  26.98 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0477  NADPH-dependent FMN reductase  33.04 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307827  normal  0.877798 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2933  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.89226  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  27.42 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5993  hypothetical protein  38.89 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  27.42 
 
 
186 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  29.13 
 
 
230 aa  42.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
192 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4080  NADPH-dependent FMN reductase  28.1 
 
 
186 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0440178  normal  0.0878712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  22.45 
 
 
188 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  26.73 
 
 
197 aa  42  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  26.04 
 
 
188 aa  42  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  24.22 
 
 
188 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  28.7 
 
 
197 aa  41.2  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>