73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0914 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0914  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
201 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0887  NADPH-dependent FMN reductase  69.8 
 
 
202 aa  291  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0994  NADPH-dependent FMN reductase  66.06 
 
 
218 aa  287  7e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1047  NADPH-dependent FMN reductase  67.62 
 
 
210 aa  286  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.418607  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3585  azoreductase, putative  64.73 
 
 
204 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3177  NADPH-dependent FMN reductase  63.77 
 
 
204 aa  266  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3080  NADPH-dependent FMN reductase  63.29 
 
 
204 aa  265  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0693742  normal  0.504641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2999  NADPH-dependent FMN reductase  63.29 
 
 
204 aa  265  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00930809  normal  0.251382 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1112  NADPH-dependent FMN reductase  62.32 
 
 
204 aa  264  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795059 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1017  NADPH-dependent FMN reductase  61.84 
 
 
204 aa  263  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1079  NADPH-dependent FMN reductase  61.84 
 
 
204 aa  262  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1010  NADPH-dependent FMN reductase  61.84 
 
 
204 aa  262  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3279  NADPH-dependent FMN reductase  61.84 
 
 
204 aa  261  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.097942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0090  hypothetical protein  51.9 
 
 
210 aa  222  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2787  azoreductase, putative  45.59 
 
 
194 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0985  NADPH-dependent FMN reductase  40.58 
 
 
202 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1997  NADPH-dependent FMN reductase  40.21 
 
 
198 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.88361  normal  0.0341206 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0067  putative oxidoreductase  36.22 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1668  azobenzene reductase  32.84 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2310  azoreductase  31.1 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.702721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2096  azobenzene reductase  33.58 
 
 
178 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284733  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2056  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  31.1 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2302  azoreductase  31.1 
 
 
178 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00698178 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2060  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  31.1 
 
 
178 aa  63.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3066  azoreductase  31.1 
 
 
178 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2259  azoreductase  31.1 
 
 
178 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2386  azoreductase  31.1 
 
 
178 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2122  azoreductase  30.49 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.120348  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2276  azoreductase  30.49 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.39855  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  28.19 
 
 
188 aa  55.8  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 
178 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 
178 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0533  NADPH-dependent FMN reductase  29.53 
 
 
176 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  24.47 
 
 
197 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  28.91 
 
 
181 aa  51.6  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  25.52 
 
 
188 aa  51.2  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  32.63 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  26.73 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  28.03 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  23.81 
 
 
188 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  27.44 
 
 
188 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  27.78 
 
 
186 aa  48.5  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  27.87 
 
 
188 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  28.29 
 
 
195 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  26.84 
 
 
350 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1954  NADPH-dependent FMN reductase  27.07 
 
 
197 aa  46.2  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.867559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  27.08 
 
 
192 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1275  NADPH-dependent FMN reductase  31.46 
 
 
192 aa  45.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  23.44 
 
 
212 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3750  NADPH-dependent FMN reductase  27.17 
 
 
199 aa  45.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2933  NADPH-dependent FMN reductase  29.13 
 
 
192 aa  45.1  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.89226  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5221  NADPH-dependent FMN reductase  26.19 
 
 
181 aa  45.1  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.681461  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3533  NADPH-dependent FMN reductase  30.25 
 
 
173 aa  45.1  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  27.17 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  32.33 
 
 
218 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  24.03 
 
 
185 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  26.63 
 
 
194 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0583  hypothetical protein  28.79 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.600123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  24.48 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0597  hypothetical protein  28.79 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2656  NADPH-dependent FMN reductase  24.59 
 
 
179 aa  43.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  21.05 
 
 
187 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00942  hypothetical protein  25.41 
 
 
197 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  29.5 
 
 
190 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0388  NADPH-dependent FMN reductase  22.28 
 
 
193 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  26.04 
 
 
372 aa  42  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5059  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 
188 aa  41.6  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004454  putative reductase  23.77 
 
 
188 aa  41.2  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.418649  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2657  NADPH-dependent FMN reductase  24.86 
 
 
171 aa  41.6  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0489341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  21.05 
 
 
193 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  26.27 
 
 
186 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>