79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0994 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0994  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 218 aa  456  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1047  NADPH-dependent FMN reductase  72.48 
 
 		 210 aa  317  9e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.418607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0887  NADPH-dependent FMN reductase  67.89 
 
 		 202 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0914  NADPH-dependent FMN reductase  66.06 
 
 		 201 aa  287  8e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3585  azoreductase, putative  61.16 
 
 		 204 aa  274  9e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3177  NADPH-dependent FMN reductase  60.27 
 
 		 204 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3080  NADPH-dependent FMN reductase  59.82 
 
 		 204 aa  269  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0693742  normal  0.504641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2999  NADPH-dependent FMN reductase  59.82 
 
 		 204 aa  269  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00930809  normal  0.251382 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1112  NADPH-dependent FMN reductase  58.48 
 
 		 204 aa  261  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795059 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1079  NADPH-dependent FMN reductase  58.04 
 
 		 204 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1017  NADPH-dependent FMN reductase  58.48 
 
 		 204 aa  260  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1010  NADPH-dependent FMN reductase  58.04 
 
 		 204 aa  259  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3279  NADPH-dependent FMN reductase  58.04 
 
 		 204 aa  259  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.097942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0090  hypothetical protein  55.05 
 
 		 210 aa  236  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2787  azoreductase, putative  41.35 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0985  NADPH-dependent FMN reductase  36.16 
 
 		 202 aa  135  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1997  NADPH-dependent FMN reductase  40.98 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.88361  normal  0.0341206 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0067  putative oxidoreductase  32.08 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1668  azobenzene reductase  29.63 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  23.86 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2310  azoreductase  28.89 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.702721  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  31.5 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  31.5 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2386  azoreductase  28.89 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2259  azoreductase  28.89 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2096  azobenzene reductase  28.89 
 
 		 178 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284733  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2056  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  28.89 
 
 		 178 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0533  NADPH-dependent FMN reductase  27.52 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3066  azoreductase  28.89 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2060  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  28.89 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2302  azoreductase  28.89 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00698178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  27.95 
 
 		 182 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2276  azoreductase  28.89 
 
 		 178 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.39855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2122  azoreductase  28.89 
 
 		 178 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.120348  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  29.8 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 		 188 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  28.74 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  29.66 
 
 		 186 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  29.75 
 
 		 188 aa  48.5  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  29.35 
 
 		 197 aa  48.1  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  28.89 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  24.54 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  34.74 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  27.05 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  34.43 
 
 		 179 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  28.93 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  31.36 
 
 		 181 aa  46.6  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1954  NADPH-dependent FMN reductase  25.82 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.867559  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  27.97 
 
 		 186 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  28.48 
 
 		 190 aa  45.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  27.97 
 
 		 186 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  27.05 
 
 		 188 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  27.05 
 
 		 188 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  27.05 
 
 		 188 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3750  NADPH-dependent FMN reductase  26.9 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  27.05 
 
 		 188 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  27.05 
 
 		 188 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  27.05 
 
 		 188 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  27.05 
 
 		 188 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  28.3 
 
 		 183 aa  45.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  26.37 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  23.72 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  27.97 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  27.16 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1148  NADPH-dependent FMN reductase  23.6 
 
 		 183 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0597  hypothetical protein  29.55 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  34.41 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0583  hypothetical protein  29.55 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.600123  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  22.29 
 
 		 193 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0206  azoreductase  28.79 
 
 		 188 aa  42.7  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.525066  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0432  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 		 193 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  32.29 
 
 		 181 aa  42  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2470  NADPH-dependent FMN reductase  26.02 
 
 		 174 aa  41.6  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.469467  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0876  flavoprotein  33.33 
 
 		 180 aa  41.6  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000003424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>