33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0067 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0067  putative oxidoreductase  100 
 
 
192 aa  397  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0985  NADPH-dependent FMN reductase  40.5 
 
 
202 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0914  NADPH-dependent FMN reductase  36.22 
 
 
201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3585  azoreductase, putative  36.41 
 
 
204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1997  NADPH-dependent FMN reductase  38.19 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.88361  normal  0.0341206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1010  NADPH-dependent FMN reductase  34.76 
 
 
204 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1112  NADPH-dependent FMN reductase  34.76 
 
 
204 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795059 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3177  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
204 aa  110  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1079  NADPH-dependent FMN reductase  34.03 
 
 
204 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2999  NADPH-dependent FMN reductase  34.13 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00930809  normal  0.251382 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3080  NADPH-dependent FMN reductase  34.13 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0693742  normal  0.504641 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3279  NADPH-dependent FMN reductase  34.03 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.097942 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0887  NADPH-dependent FMN reductase  31.68 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1017  NADPH-dependent FMN reductase  33.5 
 
 
204 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390057  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1047  NADPH-dependent FMN reductase  32.29 
 
 
210 aa  105  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.418607  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0994  NADPH-dependent FMN reductase  32.08 
 
 
218 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0090  hypothetical protein  32.38 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2787  azoreductase, putative  31.22 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  29.27 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  26.77 
 
 
186 aa  45.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2386  azoreductase  21.85 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2733  NADPH-dependent FMN reductase  26.21 
 
 
174 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2056  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  22.5 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2096  azobenzene reductase  22.5 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284733  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2310  azoreductase  22.5 
 
 
179 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.702721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2276  azoreductase  24.32 
 
 
178 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.39855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2060  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  24.32 
 
 
178 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2122  azoreductase  24.32 
 
 
178 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.120348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2302  azoreductase  24.32 
 
 
178 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00698178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  25.81 
 
 
185 aa  42.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1668  azobenzene reductase  21.93 
 
 
178 aa  42  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2259  azoreductase  21.01 
 
 
178 aa  42  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3066  azoreductase  21.01 
 
 
178 aa  42  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>