58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1017 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1017  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
204 aa  427  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1010  NADPH-dependent FMN reductase  92.16 
 
 
204 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1112  NADPH-dependent FMN reductase  91.18 
 
 
204 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795059 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3279  NADPH-dependent FMN reductase  91.67 
 
 
204 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.097942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1079  NADPH-dependent FMN reductase  91.67 
 
 
204 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2999  NADPH-dependent FMN reductase  82.84 
 
 
204 aa  364  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00930809  normal  0.251382 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3080  NADPH-dependent FMN reductase  82.84 
 
 
204 aa  364  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0693742  normal  0.504641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3177  NADPH-dependent FMN reductase  83.33 
 
 
204 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3585  azoreductase, putative  77.94 
 
 
204 aa  349  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0914  NADPH-dependent FMN reductase  61.84 
 
 
201 aa  263  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0994  NADPH-dependent FMN reductase  58.48 
 
 
218 aa  260  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1047  NADPH-dependent FMN reductase  60.19 
 
 
210 aa  258  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.418607  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0887  NADPH-dependent FMN reductase  59.62 
 
 
202 aa  257  8e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0090  hypothetical protein  49.54 
 
 
210 aa  205  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0985  NADPH-dependent FMN reductase  41.71 
 
 
202 aa  154  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2787  azoreductase, putative  43.98 
 
 
194 aa  151  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1997  NADPH-dependent FMN reductase  40.1 
 
 
198 aa  131  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.88361  normal  0.0341206 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0067  putative oxidoreductase  33.5 
 
 
192 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  33.59 
 
 
178 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  33.59 
 
 
178 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1668  azobenzene reductase  29.03 
 
 
178 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2096  azobenzene reductase  33.33 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284733  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  28.06 
 
 
350 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 
372 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  30.57 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2310  azoreductase  30.83 
 
 
179 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.702721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3066  azoreductase  32.5 
 
 
178 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2259  azoreductase  32.5 
 
 
178 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2386  azoreductase  30 
 
 
178 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2056  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  32.5 
 
 
178 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2302  azoreductase  32.5 
 
 
178 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00698178 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2060  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  32.5 
 
 
178 aa  54.7  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0533  NADPH-dependent FMN reductase  24.24 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2276  azoreductase  31.67 
 
 
178 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.39855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2122  azoreductase  31.67 
 
 
178 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.120348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  31.13 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1954  NADPH-dependent FMN reductase  27.97 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.867559  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  29.77 
 
 
182 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  28.24 
 
 
181 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  29.1 
 
 
188 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  32.79 
 
 
188 aa  48.1  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  27.04 
 
 
195 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  28.95 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1148  NADPH-dependent FMN reductase  28.46 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148322  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  26.83 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  26.02 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  26.28 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  31.18 
 
 
192 aa  45.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5221  NADPH-dependent FMN reductase  27.48 
 
 
181 aa  45.1  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.681461  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  26.02 
 
 
186 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  22.51 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  26.02 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3750  NADPH-dependent FMN reductase  28.47 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  25.83 
 
 
187 aa  42.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  23.44 
 
 
190 aa  42.4  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  23.84 
 
 
186 aa  42.7  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4080  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 
186 aa  42  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0440178  normal  0.0878712 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  23.08 
 
 
216 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>