70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1997 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1997  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.88361  normal  0.0341206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0985  NADPH-dependent FMN reductase  43.75 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0887  NADPH-dependent FMN reductase  43.92 
 
 		 202 aa  157  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1047  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.418607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3080  NADPH-dependent FMN reductase  42.25 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0693742  normal  0.504641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2999  NADPH-dependent FMN reductase  42.25 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00930809  normal  0.251382 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3177  NADPH-dependent FMN reductase  42.55 
 
 		 204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3585  azoreductase, putative  42.86 
 
 		 204 aa  144  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1017  NADPH-dependent FMN reductase  40.1 
 
 		 204 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390057  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0090  hypothetical protein  36.95 
 
 		 210 aa  144  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0994  NADPH-dependent FMN reductase  40.98 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1112  NADPH-dependent FMN reductase  40.64 
 
 		 204 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795059 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1079  NADPH-dependent FMN reductase  40.43 
 
 		 204 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1010  NADPH-dependent FMN reductase  40.43 
 
 		 204 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0914  NADPH-dependent FMN reductase  40.21 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3279  NADPH-dependent FMN reductase  40.43 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.097942 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0067  putative oxidoreductase  38.19 
 
 		 192 aa  124  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2787  azoreductase, putative  39.58 
 
 		 194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.768213 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  30.41 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0533  NADPH-dependent FMN reductase  28.46 
 
 		 176 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2310  azoreductase  26.92 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.702721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2096  azobenzene reductase  32.08 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284733  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2276  azoreductase  27.13 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.39855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2122  azoreductase  27.13 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.120348  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  26.2 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2259  azoreductase  31.13 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2056  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  31.13 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3066  azoreductase  31.13 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  25.41 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  26.5 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  29.94 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  25.41 
 
 		 178 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  25.41 
 
 		 178 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2302  azoreductase  31.13 
 
 		 178 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00698178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  33.06 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2060  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  31.13 
 
 		 178 aa  48.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2386  azoreductase  31.13 
 
 		 178 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2123  NADPH-dependent FMN reductase  29.37 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2933  NADPH-dependent FMN reductase  26.23 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.89226  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  31.11 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2733  NADPH-dependent FMN reductase  29.38 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  28.57 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  26.81 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  26.42 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1668  azobenzene reductase  30 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  32.28 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  25.77 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  26.74 
 
 		 181 aa  45.1  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1148  NADPH-dependent FMN reductase  27.54 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  32.28 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  33.06 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  26.9 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.73 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  31.45 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  28.26 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  29.74 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  31.45 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  34.92 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  34.92 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  29.74 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  29.74 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  31.15 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  31.15 
 
 		 189 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0597  hypothetical protein  26.77 
 
 		 188 aa  42  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1504  flavoprotein-like protein  26.94 
 
 		 199 aa  42  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0437844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0583  hypothetical protein  26.77 
 
 		 188 aa  42  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.600123  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  27.72 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  27.5 
 
 		 183 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  29.77 
 
 		 197 aa  41.2  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 		 183 aa  41.2  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>