More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1745 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  387  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  69.02 
 
 
185 aa  271  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  33.15 
 
 
188 aa  104  7e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  31.89 
 
 
192 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  29.44 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  31.87 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  29.44 
 
 
192 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  29.44 
 
 
192 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  39.23 
 
 
186 aa  87  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 
178 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 
178 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  36.76 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00942  hypothetical protein  32.08 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  29.89 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  31.07 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  30.51 
 
 
193 aa  82  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  29.47 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1339  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004454  putative reductase  34.87 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.418649  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  30.37 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  29.82 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  27.72 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  32.19 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  36.15 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  30.12 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  33.12 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  27.37 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  35.62 
 
 
209 aa  79  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  28.26 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  29.12 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  30.86 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  26.49 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  32.28 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  26.49 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  33.03 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  36.36 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  27.13 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  36.11 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  28.93 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  26.15 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  33.85 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  32.35 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  28.72 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0533  NADPH-dependent FMN reductase  28.26 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  34.75 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  28.99 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  29.69 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4290  putative NADPH-dependent FMN reductase  27.13 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  25.67 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  29.73 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  31.72 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  25.41 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0263  NADPH-dependent FMN reductase  29.32 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.478273  normal  0.331111 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17270  predicted flavoprotein  29.75 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  26.82 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  27.56 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  29.56 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  25.26 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  26.42 
 
 
192 aa  67  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  28.1 
 
 
188 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  30.17 
 
 
205 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  32.74 
 
 
187 aa  67  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  26.7 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  30.07 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1668  azobenzene reductase  27.27 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  32.28 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  24.19 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2199  NADPH-dependent FMN reductase  25.45 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2933  NADPH-dependent FMN reductase  25.16 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.89226  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1082  hypothetical protein  29.7 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137626  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5059  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5221  NADPH-dependent FMN reductase  26.43 
 
 
181 aa  63.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.681461  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  25.97 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  32.48 
 
 
197 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  25.13 
 
 
190 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  30.37 
 
 
214 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  27.68 
 
 
186 aa  62  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2470  NADPH-dependent FMN reductase  29.11 
 
 
174 aa  62.4  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.469467  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00481  putative reductase  30 
 
 
174 aa  62  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.543235  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  24.07 
 
 
212 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2714  NADPH-dependent FMN reductase  27.45 
 
 
223 aa  61.2  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2122  azoreductase  28.87 
 
 
178 aa  60.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.120348  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  27.52 
 
 
194 aa  61.2  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  30.25 
 
 
188 aa  61.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2276  azoreductase  28.87 
 
 
178 aa  60.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.39855  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  23.66 
 
 
201 aa  60.8  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2310  azoreductase  28.47 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.702721  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2123  NADPH-dependent FMN reductase  25.66 
 
 
195 aa  60.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1677  NADPH-dependent FMN reductase  28.83 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  35.4 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1275  NADPH-dependent FMN reductase  27.34 
 
 
192 aa  60.5  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  27.47 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0432  NADPH-dependent FMN reductase  23.75 
 
 
193 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0985  NADPH-dependent FMN reductase  29.55 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2096  azobenzene reductase  28.37 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284733  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  29.92 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>