281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5934 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
214 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  55.43 
 
 
202 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  52.15 
 
 
190 aa  185  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  50.54 
 
 
194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  47.85 
 
 
193 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  48.54 
 
 
230 aa  165  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  48.96 
 
 
197 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  55.98 
 
 
205 aa  162  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  50.27 
 
 
189 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  50.27 
 
 
189 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  49.19 
 
 
186 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  44.08 
 
 
227 aa  148  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  41.58 
 
 
197 aa  142  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  43.85 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  45.13 
 
 
205 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  46.2 
 
 
198 aa  138  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  41.62 
 
 
178 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  44.85 
 
 
192 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  42.02 
 
 
188 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  43.32 
 
 
194 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  44.32 
 
 
187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  42.02 
 
 
190 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  39.49 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  42.54 
 
 
186 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  36.9 
 
 
209 aa  111  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  36.82 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  38.5 
 
 
191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  35.38 
 
 
372 aa  108  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 
199 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  35.05 
 
 
192 aa  107  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  38.3 
 
 
197 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  37.7 
 
 
350 aa  105  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  33.51 
 
 
192 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3505  NADPH-dependent FMN reductase  42.54 
 
 
188 aa  102  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.647475  normal  0.990835 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  31.22 
 
 
190 aa  102  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  32.09 
 
 
187 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  38.2 
 
 
187 aa  102  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  34.78 
 
 
183 aa  101  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  39.73 
 
 
188 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3838  NADPH-dependent FMN reductase  40.84 
 
 
190 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  32.99 
 
 
188 aa  98.2  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  37.7 
 
 
192 aa  95.5  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
190 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  40.56 
 
 
188 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  35.98 
 
 
183 aa  92.8  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  30.32 
 
 
188 aa  92.8  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4166  NADPH-dependent FMN reductase  39.27 
 
 
190 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3024  NADPH-dependent FMN reductase  37.7 
 
 
186 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  41.06 
 
 
201 aa  89.4  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  35.38 
 
 
192 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  32.16 
 
 
197 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  38.97 
 
 
197 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  36.51 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  36.51 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  35.45 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4580  NADPH-dependent FMN reductase  34.93 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4165  NADPH-dependent FMN reductase  37.74 
 
 
113 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174255  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  32.58 
 
 
184 aa  72  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  32.58 
 
 
184 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
192 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  31.96 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17270  predicted flavoprotein  35.34 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37671  predicted protein  30.67 
 
 
289 aa  68.6  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  36.3 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  35.56 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03840  conserved hypothetical protein  26.42 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  35.56 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  29.17 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  36.81 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.25 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0876  flavoprotein  34.78 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000003424  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  29.53 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  31.91 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  31.91 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  31.91 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  31.91 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  30.87 
 
 
183 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  31.91 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  31.91 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  31.91 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  27.61 
 
 
219 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5059  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 
188 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  34.53 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  34.53 
 
 
183 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  26.4 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  31.91 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.81 
 
 
185 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  34.81 
 
 
185 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.81 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  30.37 
 
 
186 aa  63.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2714  NADPH-dependent FMN reductase  29.23 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  31.91 
 
 
194 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  31.91 
 
 
188 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  31.52 
 
 
188 aa  62.4  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  31.91 
 
 
188 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  31.91 
 
 
188 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>