190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4580 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4580  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 303 aa  603  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2123  NADPH-dependent FMN reductase  50.26 
 
 		 199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3024  NADPH-dependent FMN reductase  53.85 
 
 		 186 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4166  NADPH-dependent FMN reductase  51.1 
 
 		 190 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3838  NADPH-dependent FMN reductase  50.55 
 
 		 190 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5533  NADPH-dependent FMN reductase  44.5 
 
 		 197 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0330  NADPH-dependent FMN reductase  43.08 
 
 		 197 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6847  NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 		 197 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03220  predicted flavoprotein  38.54 
 
 		 187 aa  125  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1668  NADPH-dependent FMN reductase  43.09 
 
 		 192 aa  126  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00564362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2060  putative reductase  38.02 
 
 		 191 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.295674  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0094  NADPH-dependent FMN reductase  39.68 
 
 		 190 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17676  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2087  NADPH-dependent FMN reductase  37.97 
 
 		 190 aa  112  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0915139  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 		 190 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4123  putative reductase  38.62 
 
 		 186 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19680  predicted flavoprotein  40.76 
 
 		 192 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.791559  hitchhiker  0.0073412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9230  putative reductase  36.04 
 
 		 209 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3551  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 		 197 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2386  NADPH-dependent FMN reductase  38.62 
 
 		 188 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1740  putative reductase  41.4 
 
 		 188 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0533  hypothetical protein  31.75 
 
 		 190 aa  102  9e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  37.37 
 
 		 214 aa  99.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1578  NADPH-dependent FMN reductase  35.94 
 
 		 192 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642215  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 194 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  35.79 
 
 		 193 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  32.62 
 
 		 187 aa  96.3  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0945  NADPH-dependent FMN reductase  36.27 
 
 		 189 aa  95.9  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.281107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2693  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 192 aa  95.9  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2088  NADPH-dependent FMN reductase  34.39 
 
 		 195 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  36.65 
 
 		 197 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  36.87 
 
 		 183 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1470  NADPH-dependent FMN reductase  35.23 
 
 		 188 aa  91.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1310  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 		 190 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9258  flavoprotein  37.3 
 
 		 189 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  34.87 
 
 		 197 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1236  putative reductase  35.94 
 
 		 227 aa  89.7  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5102  putative reductase  33.33 
 
 		 183 aa  89.4  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0748  NADPH-dependent FMN reductase  38.3 
 
 		 187 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1545  NADPH-dependent FMN reductase  30.41 
 
 		 203 aa  85.5  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689232  normal  0.1132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1371  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 		 205 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1342  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 		 192 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4938  NADPH-dependent FMN reductase  36.27 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0897945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3973  NADPH-dependent FMN reductase  34.59 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0654  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.922611 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 192 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5477  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 		 205 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  30.46 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0942  NADPH-dependent FMN reductase  32.98 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.035614  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  32.8 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  32.45 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4889  NADPH-dependent FMN reductase  31.05 
 
 		 186 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  30.11 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5947  NADPH-dependent FMN reductase  32.45 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.616101  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4948  NADPH-dependent FMN reductase  33.85 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1024  flavoprotein  32.8 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0029  NADPH-dependent FMN reductase  29.37 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162368  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1937  NADPH-dependent FMN reductase  32.83 
 
 		 201 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0927039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2455  NADPH-dependent FMN reductase  31.94 
 
 		 192 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4165  NADPH-dependent FMN reductase  37.27 
 
 		 113 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1339  NADPH-dependent FMN reductase  30.9 
 
 		 196 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5059  NADPH-dependent FMN reductase  30.11 
 
 		 188 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  30.48 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2517  NADPH-dependent FMN reductase  28.87 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313233  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004454  putative reductase  31.01 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.418649  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1903  NADPH-dependent FMN reductase  26.11 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.348571  normal  0.573134 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  31.64 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1363  NADPH-dependent FMN reductase  26.98 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  32.59 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00942  hypothetical protein  31.78 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  32.39 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  32.39 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2714  NADPH-dependent FMN reductase  29.57 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17270  predicted flavoprotein  31.25 
 
 		 180 aa  58.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  29.53 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1745  hypothetical protein  25.81 
 
 		 186 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  28.89 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3505  NADPH-dependent FMN reductase  35.16 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.647475  normal  0.990835 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  31.62 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  28.37 
 
 		 184 aa  57  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  30.37 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  30.54 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  28.75 
 
 		 183 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  29.79 
 
 		 182 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  30.15 
 
 		 183 aa  53.9  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4290  putative NADPH-dependent FMN reductase  27.98 
 
 		 196 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618553 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  28.37 
 
 		 187 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  28.37 
 
 		 197 aa  52.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  29.37 
 
 		 186 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37671  predicted protein  28.91 
 
 		 289 aa  52.4  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  31.16 
 
 		 184 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  30.5 
 
 		 194 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  30.5 
 
 		 194 aa  52.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  29.63 
 
 		 183 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03840  conserved hypothetical protein  26.8 
 
 		 213 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  30.61 
 
 		 185 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  29.71 
 
 		 184 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  38.37 
 
 		 185 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  27.33 
 
 		 184 aa  49.7  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  28.91 
 
 		 178 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>